2022-09-29 16:23:40来源:医脉通阅读:10次
译者:廖占林 福建省南平市第一医院
引言:2022年9月19日至23日,国际内分泌领域的重磅会议「2022年欧洲糖尿病研究协会年会」于瑞典斯德哥尔摩以“线上+线下”的形式举行。会上有学者分享了题为《
1型糖尿病遗传风险与C肽的相关性
1型糖尿病血清C肽遗传概率为26%,既往2个独立的1型糖尿病C肽全基因组关联分析(GWAS)研究确定了人类白细胞抗原(HLA)区域及胰岛素(INS)基因区域的多个位点和1号
该研究纳入了4项研究共计7248例非欧洲裔1型糖尿病患者,包括SDRNT1BIO研究(样本量4824例,随机C肽水平)、DCCT(样本量1304例,空腹C肽水平)研究、CACT1研究(样本量529,空腹C肽水平)、WESDR研究(样本量591,随机C肽水平)。GWAS中基因分型由Illumina基因芯片完成;非基因型变异是由迄今为止最大参考模板TOPMed平台完成,该平台较以前参考模板引入更小频率基因变异且有更好分析能力。SDRNT1BIO研究和DCCT研究中均显示了其可以分析频率>0.01的小等位基因的单核苷酸多态性(SNPs)和高归因分析能力(INFO>0.80),上述两项研究被纳入了该项样本量达8150645例的GWAS-meta分析研究。用密歇根估算服务器中的多种族HLA参考模板来评估HLA区域的经典HLA等位基因、氨基酸序列和额外发现的SNPs位点。通过校正一些协变量(性别、确诊年龄、病程)后进行C肽多元线性回归来评估该研究的效应量和标准误。该GWAS-meta分析是利用METALv1.5工具的标准误倒数来加权效应量。该研究检测了HLA区域中1型糖尿病GRS评分与C肽水平的相关性。共同分析1型糖尿病HLA区域的GRS评分并用来区分DR-DQ和非DR-DQ单倍体。非DR-DQ单倍体被分为经典1型、DPB1型和没有位于经典HLA位点但调节了HLA-II型基因表达的位于DRB1和DQA1间的间区基因。
1型糖尿病HLA区域变异性与C肽水平相关,而DR-DQGRS评分则相反
该研究确定了HLA区域的相关位点,包括rs9271349基因(A/G,Chr6:32616053)(β(SE)=0.57(0.08),p=1.62E-12)。
在HLA归因中,DRB1*06:02(β(SE)=0.90(0.11),p=1.18E-16)基因和
DRB1*15:01基因(β(SE)=0.70(0.10),p=1.68E-12)是相关的。HLA-DRB1、HLA-DQB1和HLA-A的5种氨基酸变化达到了全基因组显著性阈值。
在这四项研究里,DR-DQGRS评分并不与C肽水平相关,而非DR-DQGRS评分与低C肽水平相关,SDRNT1BIO(β=-0.17,p=2.00E-8),DCCT(β=-0.06,p=0.045),CACTI(β=-0.08,p=0.015)和WESDR(β=-0.10,p=6.44E-4)。最主要来自于HLAI类基因(A*2402、B*3906、A*2902)和间区基因(rs9271346、rs116522341、rs1281934)。
HLA-A*2402、HLA-B*3906和基因间区GRS评分s是与低C肽水平相关,而HLA-A*2902GRS评分与高C肽水平相关。
结论
就与C肽水平相关性来说,1型糖尿病HLA区域变异性与之有相关性,1型糖尿病DR-DQGRS评分并不与C肽水平相关,这可能为最终揭示保持β细胞功能的机制提供方向,为保护β细胞功能提供可能性。
译者介绍
廖占林
医学硕士
目前主持福建省科学自然基金一项
擅长糖尿病、