精确度超90%！DNA甲基化或作为「甲状腺癌」新标志物｜2022ATA

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引言：DNA甲基化是主要的表观遗传修饰形式之一，在癌症的发生和发展中起着至关重要的作用，并由于其组织特异性和稳健性，有望成为有潜力的肿瘤标志物。

来自中国学者的一项研究发现，将研究分析的DNA甲基化特征形式标志物用于诊断甲状腺结节，其估计的诊断特异性达94.1%，灵敏度也超90%。未来，或基于此开发新的甲状腺癌分子诊断工具。该结果已在2022年美国甲状腺协会年会（2022ATA）上公布。

诊断甲状腺结节需要更精确的标志物

由于甲状腺恶性与良性结节具有共同的细胞学特征，甲状腺癌通常难以通过细针穿刺（FNA）准确诊断出。虽然有辅助诊断的分子工具，如应用最广泛的Afirma基因表达分类器和ThyroSeqv3，但分子检测工具均显示出低阳性预测值（PPV：47%-66%）。因此，需要开发一种高度准确的甲状腺结节诊断工具，可以增加PPV，从而减少不必要的手术。

DNA甲基化是DNA上的额外信息层，由于其组织特异性和稳健性，它是用于肿瘤诊断和监测的有潜力的生物标志物。为了开发一种新的甲状腺癌分子诊断测试工具，研究对单核苷酸水平的全基因组甲基化谱进行还原，并通过亚硫酸氢盐测序（RRBS）分析，分析了恶性和良性甲状腺组织中的DNA甲基化。研究发现良性结节和肿瘤组织之间存在显著差异，其中大多数差异在于甲基化区域富含与免疫反应相关的273个基因。

DNA甲基化诊断特异性、灵敏度均超90%

研究共确定了780个可用作甲状腺结节诊断的分化的DNA甲基化特征（DDMS），它们可作为标志物以准确地区分恶性结节和良性结节。

研究使用上述780个DDMS建立了一个随机森林模型，其性能显示：

➤估计的诊断的特异性为94.1%[95%置信区间（CI），93%-96%]；

➤灵敏度为92.3%（95%CI，91%-94%）；

➤阳性预测值为92.3%（95%CI 91%-94%）；

➤阴性预测值为94.1%（95%CI 93%-96%）。

本文小结

这些初步数据表明，DNA甲基化在诊断甲状腺结节方面具有出色的性能。未来，可以开发出基于DNA甲基化的分子诊断工具。

参考资料：LONG‐TERM MORTALITY AND CARDIOMETABOLIC EFFECTS OF TREATMENT FOR HYPERTHYROIDISM： EGRET STUDY. THYROID

Volume 32， Supplement 1，2022.https：//doi.org/10.1089/thy.2022.29140.lb.abstracts