闫金松教授团队 | 聚焦血液肿瘤诊治的优化研究：新融合基因鉴定及精准治疗

立足于血液病精准诊疗，解决血液病临床问题，是大连医科大学附属第二医院闫金松教授团队的主要科研方向。团队通过血液肿瘤患者样本的全转录组测序（WTS）联合生物信息学分析方法在多例疑难血液病中识别出新的融合基因，实现了血液病的精准诊断和治疗。

近来，闫金松教授团队诊治1例疑难B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）患者，临床表现出高白细胞的特征，在标准的Hyper-CVAD化疗方案治疗缓解后随即复发。因此，推断该患者可能存在异常的分子特征。通过WTS联合生物信息学分析，在该患者中筛选并鉴定出新融合基因TPR-PDGFRB，患者的诊断从早期前体B-ALL（Pro-B-ALL）修订为费城染色体样急性淋巴细胞白血病（Ph-like ALL）。基于该基因的特点，选择达沙替尼联合DOCPL方案（长春新碱，吡柔比星，地塞米松，培门冬酶，环磷酰胺），患者在1个月内达到完全缓解。第2例患者确诊为骨髓增生异常综合征（MDS）伴有异常单克隆B淋巴细胞增多，合并8号环状染色体异常，应用标准方案化疗无效。采用同样策略，鉴定出新融合基因HOOK3-FGFR1，修订诊断为8p11骨髓增殖综合征（EMS），应用ponatinib联合化疗，虽然患者未达到完全缓解，但患者体内异常B细胞克隆得到清除。

采用上述技术策略，该研究团队鉴定出一系列新的融合基因，对于部分疑难血液病的精准诊疗提供了思路，现就其中2项成果进行分享。

TPR-PDGFRB的鉴定及研究

闫金松教授团队应用WTS测序分析在1例疑难B-ALL患者中鉴定出新融合基因TPR-PDGFRB，进一步应用荧光原位杂交（FISH）方法确认了患者细胞携带PDGFRB以及FGFR1重排荧光信号，实时荧光定量PCR（qRT-PCR）和Sanger测序验证了新融合转录本中发生融合的连接位置，TPR-PDGFRB由TPR基因的1-46外显子和PDGFRB基因的11-23外显子组成。同时，团队发现TPR-PDGFRB融合转录本可以编码融合蛋白，并且，携带TPR-PDGFRB融合基因的患者在靶向药的治疗下达到完全缓解，为临床上患者的治疗带来曙光。此外，团队还观察到伴随疾病缓解和复发，TPR-PDGFRB融合转录本的频率会降低和升高，表明其可能作为一个新的分子标志物用于追踪Ph-like ALL患者的微小残留病（MRD）情况。

团队进一步对该例Ph-like ALL患者的初发和复发样本进行单细胞RNA测序（scRNA-seq），在复发样本中发现了富集的B细胞亚群，且该细胞亚群特征基因的高表达与B-ALL患者的不良预后显著相关，同时也发现Ph-like ALL特异的B细胞亚群和二者共有的抑制性受体信号CLEC2D异常表达的恶性B细胞亚群（图1）。这两类高危的B-ALL亚型中CLEC2D-CD161免疫逃逸信号可能被激活，并可能成为未来免疫治疗潜在的靶点，为ph-like ALL发病的分子基础增加了一个新融合基因。该成果在Experimental Hematology & Oncology（IF=10.9）杂志发表¹。

图1 Ph-like ALL患者的转录异质性和动态演变

HOOK3-FGFR1的鉴定及研究

采用同样的策略，闫金松教授团队在1例MDS患者中鉴定出HOOK3-FGFR1新融合基因。研究发现HOOK3-FGFR1由HOOK3基因的1-11外显子与FGFR1基因的10-18外显子连接形成（图2），HOOK3-FGFR1融合阳性患者NF-κB信号显著上调。磷酸化的p65、IKBα和TAK1在转染HOOK3-FGFR1融合基因的293T细胞中显著上调，证明HOOK3-FGFR1融合阳性患者的NF-κB信号被激活。因此，NF-κB抑制剂具有作为FGFR1基因重排患者联合治疗药物的潜力，为携带FGFR1基因重排的EMS的诊疗提供了新的思路及潜在的治疗靶点。该成果已在Cancer Cell International（IF=5.8）杂志发表²。

图2 使用PCR和Sanger测序验证HOOK3-FGFR1融合基因，其结构为HOOK3外显子1-11连接FGFR1外显子10-18

疑难血液病精准诊断及治疗展望

疑难血液病的异常分子特征改变存在异质性，新融合基因的筛选鉴定为精准诊疗提供了可能。研究团队已经将WTS鉴定新融合基因的方法应用于难治复发的血液肿瘤，目前已识别出若干融合基因：ETV6-NTRK3、NUP98-PRRX2、NUP98-HOXC13、NUP98-CDCA7L、ZNF292-PNRC1、ZEB2-CXCR4、MEF2D-DAZAP1、PAX5-GSE1、TCF3-RER1、MYB-PLAGL1、RNIL-SYK等。这些新融合基因的鉴定方式和临床应用，为血液肿瘤的精准诊疗打下基础，也进一步提高了疑难血液肿瘤的诊疗水平。

闫金松 教授

医学博士、主任医师、博士生导师

大连医科大学附属第二医院血液科主任、内科教研室主任

辽宁省“兴辽英才计划”科技创新领军人才

辽宁省特聘教授

辽宁省青年名医

辽宁省造血干细胞移植医学中心主任

辽宁省造血干细胞移植转化医学研究重点实验室主任

大连医科大学血液干细胞移植研究所主任

中华医学会血液专业委员会委员

辽宁省血液学专业委员会主任委员

辽宁省医师协会内科分会副会长

辽宁省科教文卫系统“闫金松职工创新工作室”负责人，大连政协委员。

师从陈赛娟院士，多年来从事骨髓移植及血液系统疾病的诊疗工作。

主持国自然基金项目及省市重点科研项目20余项，发表SCI文章30余篇，包括Blood，PNAS，Leukemia，CDD等专业杂志，申请发明专利10余项。

张学红 博士

先后获得生物技术专业理学学士学位、生物医学工程硕士学位和内科学（血液病）博士学位。

擅长血液肿瘤新融合基因的识别和临床应用研究。

任职于大连医科大学肿瘤干细胞研究院，从事肿瘤基因组学和生物信息学相关研究。

主持国家自然科学基金青年基金项目，发表SCI论文20篇，如Blood、Experimental Hematology & Oncology等。

MAT-CN-2327587/0.2/OCT.2023（本编号仅作为赛诺菲对本文章所涉及的赛诺菲相关药物所属治疗领域科学和临床数据来源真实性的确认，不作为赛诺菲对本文章全部内容准确性、时效性和完整性的确认和保证。）