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年度总结 | 2023年度中国生命科学CNS论文总结和回顾

2024-01-02 13:07:29来源:BioArt阅读:133次

编者的话
按惯例,先简单总结和回顾过去一年中国生命科学领域高水平论文发表的基本情况。2023年度,中国内地学者以通讯作者(含共同)CellNatureScience(简称“CNS”)上发表的研究论文总数为136(其中Science 29篇,Nature 50篇,Cell 57篇,详细列表见文后,比去年增加11篇,如果排除新冠论文的影响(2022年新冠论文14篇,2023年新冠论文仅3篇),比去年增加22篇,增幅在20%左右从5年纵向来看,比2019年度增加30篇(5年增幅~28%)需要特别指出的是,2023年Science论文数量较上一年减少10篇(2022年40篇),而Cell则是大幅增长(2022年31篇,增幅约84%。从总的研究论文发文占比来看,2021年国内发文占比~10%,2023年占比~20%)
再来看看生命科学领域最具有权威性的子刊情况(考虑到广大同行认可的最大公约数,仅选取Cancer Cell、Cell Stem Cell、Immunity、Neuron、Cell Metabolism、Molecular Cell、Developmental Cell、Nature Immunology、Nature Medicine、Nature Genetics、Nature Neuroscience、Nature Cell Biology、Nature Biotechnology、Nature Methods14本杂志),2023年度上述14本子刊发表国内研究论文~280篇,比去年增加~47篇,增幅在20%左右(与CNS的增幅持平),从5年纵向来看,比2019年度增加~100篇。关于上述14本杂志,BioArt近期也进行了总结整理,详见:(8篇!中国学者2023年Nature Immunology论文发表汇总16篇!中国学者2023年Nature Medicine论文发表汇总19篇!中国学者2023年Cancer Cell论文发表汇总10篇!中国学者2023年Nature Neuroscience论文发表汇总20篇!中国学者2023年Nature Cell Biology论文发表汇总18篇!中国学者2023年Cell Stem Cell论文发表汇总),其它杂志汇总视情况陆续发布。
 
小结一下14本子刊。因为近几年Cancer CellNature Medicine特别重视临床研究,近5年国内发文显著增加,从2019年12篇增长为2023年的33篇;经典的细胞生物学杂志Nature Cell Biology在2019年发表国内论文的数量跃迁到21篇后,再过5年也只有20篇,相当稳定;Nature Immunology的表现和NCB相似,2019年发表国内8篇,2023年仍然还是8篇,考虑到免疫的另一本同当量的杂志Immunity的表现,数字稍微没那么尴尬,从12篇上升到20篇;Nature Neuroscience的表现就略显尴尬了,2019年发表13篇,到2023年反而下降到8篇,这个尴尬可以用Neuron的增长抵消一二,Neuron从18上升至26;发育和干细胞的表现较好,Cell Stem CellDev Cell合计从2019年的21篇到2023年的46篇;方法技术类杂志NBT和Nature Methods的表现也不错,从2019年的12篇上升至2023年的32篇(实际上2021年这两本杂志已经发表34篇,说明近几年趋于平稳);代谢领域如果引入第15本子刊Nature Metabolism一起考虑的话,和Cell Metabolism相加,从2019年的17篇上升到2023年的57篇,可谓突飞猛进(主要是Nature Metabolism 2019年创刊,从当年3篇上升为2023年的30篇),分子生物学的经典老牌期刊Mol Cell近5年发表国内的研究论文稳定在30-40篇左右,2023年表现最好,发表~40篇。另外没有计入在内的,Nature Chemical BiologyNat Biomed Eng近5年合计从20篇增长到近60篇。
 
此外,Nature CommunicationsScience Advances两本OA期刊发表国内生命科学领域1000篇左右研究论文,也是不可忽视。
 
近年来,国内主办的新期刊也越来越多(每年都有数十本入选科协卓越计划),越来越有影响力,尽管学术同仁内心都有一杆秤去衡量,但是不可否认Cell Research、Moleular Plant、National Science Review、Protein & Cell等为代表的国产期刊将发挥着越来越重要的作用和影响力。
 
说完杂志和论文再谈谈2023年广受关注的几个热门话题。
 
1、院士选举。2023年度院士增选制度进行了全面的改革,总体而言在不同的议论层面,本次改革和最终结果还是广受学术同仁认可,至少生命科学与医学学部来看,新当选者整体而言还是广受认可。此处省略1000字......
 
2、学术会议。2023年的学术会议多的不可想象,从年初到年末,几乎都排满了会(医药反腐对生命科学行业学术会议影响不大)。很难想象你有可能一年中听十次以上几乎一样的报告(陈寅恪先生过去讲课,说书上有的不讲,别人讲过的不讲,自己讲过的也不讲。博学如陈先生,如果在当下恐怕也没有那么每次不重复的内容。哈佛大学张毅教授2023年回国私下表示他可以讲10次不一样的PPT报告内容。),大家都在抱怨会议,大家也都还是要参加会议,因为现在的研究经费总体上还是偏少,绝大多数PI都不敢懈项目申请和评审,实际情况是你中有我我中有你,如果人人都有新基石这个当量的经费(当然这是不可能的,毕竟第二期新基石名单同行已经议论纷纷,已经暂停一年,下次申请要2025了),会议可以削减90%。当然,2023年有几个会需要特别提一下,昌平实验室主办的DNA双螺旋发现70周年国际学术论坛几乎以史无前例的阵容在全网进行了直播,让广大追寻高品质学术的师生享受了一次学术盛宴,深圳SMART和西湖大学的几场高规格会议阵容也可圈可点。另外,苏州冷泉港的国际会议正在复苏中,尽管恢复到鼎盛时期尚需时日,但是新的报告厅和新的交流场带了久违的多元化的国际学术交流的氛围,纯粹的高水平国际会议学术交流还是必不可少。
 
3.Biotech产业。许多Biotech在2023可能考虑的最多的是如何穿越资本寒冬。2020-2022这几年间年国内由PI创业主导的Biotech遍地开花,不同赛道明星企业的估值一浪高过一浪,朋友圈几乎每天都有融资的重磅新闻,资本在高校和研究院所堵门排队的情况屡见不鲜,有些领域只要你是个还不错的研究人员随便都可以有人主动给融资三五千万,有些研究院所的PI被号召全部都创业。都不用说时过境迁,也就短短一年左右,资本和创业者甲乙方互换,朋友圈一年也没看到几个重磅融资新闻,好多资本直接撤销了生物医药部门,之前估值数十亿的明星企业有些已经悄无声息在维持与挣扎,很多Biotech都迎来了大的裁员潮,整栋楼一夜之间都可以成空。尽管国内Biotech的寒冬主要是受国外大环境逐渐传导过来的,但是这一轮的寒潮戳破了很多繁荣下的泡沫,让创业者和投资人都有了更深层次的思考。实际上,好的Biotech项目在资本市场不缺投资,资本有限的情况下还是应该倾斜给真正创新并在国际上会有竞争力的企业。中国的Biotech任重道远,行业期待回暖,也必将回暖,只有产业发展好了,整个生命科学行业的从业人员才有获得感,毕竟更多生物博士的未来是汇集到产业发展中建功立业,而不是只有博后-PI-培养博士-博后-PI这样的循环。2024,一起努力!
 
4.基金委改革、新基石评选。此处省略2000字......
迎接新年,人们总是期盼拥抱下一个美好的春天。现实生活中,大家平常总是忙忙碌碌,回首过去又会慨叹时光匆匆。“儿童散学归来早,忙趁东风放纸鸢”(清·高鼎 《村居》),面对日常无尽的忙碌,何不学一回儿童趁着东风放飞真实的内心,寻找一下可能的诗和远方。风筝在飞,人群在笑,其乐也融融。儿童放飞的不是风筝,是青春年少,我们需要放飞的也不是风筝,是无悔人生。
 
穿过寒冬,2024年仍是充满希望的一年,可以少一点豪言壮语,多一分平常心阅尽世间“繁花”。最后BioArt编辑部衷心祝愿广大读者朋友们新年快乐,身体健康!
 
2023年度中国生命科学CNS合集
(说明:合集分Science、NatureCell系列,按在线时间先后顺序列表,部分署名国外单位为主兼署国内单位的论文不计入,国内作者为共同通讯作者的论文计入)
 

2023年Science

(研究性文章29篇,特邀综述1篇)
 

 

1. Zhou Xiaojuan., Li Ang., Mi Xue., Li Yixuan., Ding Zhaoyi., An Min., Chen Yalan., Li Wei., Tao Xianming., Chen Xinfeng., Li Ying.(2023). Hyperexcited limbic neurons represent sexual satiety and reduce mating motivation. Science, 379(6634), 820-825. (20230209,北京脑科学与类脑研究中心,李莹

 

首次在小鼠大脑边缘系统的终纹床核中发现可以持续编码过往性经验的神经环路,阐明性经验如何影响两性动物的交配动机,为理解大脑如何编码动机状态并影响本能行为抉择这一重要科学问题提供了新见解。(Science | 李莹实验室揭示性经验如何引起大脑内部状态改变

 

2. Lin Jianwei., Wu Yiping., Tian Gaofei., Yu Daqi., Yang Eunjeong., Lam Wai Hei., Liu Zheng., Jing Yihang., Dang Shangyu., Bao Xiucong., Wong Jason Wing Hon., Zhai Yuanliang., Li Xiang David.(2023). Menin "reads" H3K79me2 mark in a nucleosomal context. Science, 379(6633), 717-723.(20230216,香港大学,李祥、翟元樑、黃永瀚、鲍秀丛

 

作者开发了一种基于核小体的光亲和探针,用来捕获在核小体环境下识别 H3K79 二甲基化(H3K79me2)的蛋白质。结合定量蛋白质组学方法,该探针成功鉴别了menin为H3K79me2的“阅读器”。(专家点评Science突破丨众里寻他,李祥团队终于鉴定到H3K79me2组蛋白修饰的“阅读器”——Menin

 

3. Qin Tao., Zhang Guokun., Zheng Yi., Li Shengyou., Yuan Yuan., Li Qingjie., Hu Mingliang., Si Huazhe., Wei Guanning., Gao Xueli., Cui Xinxin., Xia Bing., Ren Jing., Wang Kun., Ba Hengxing., Liu Zhen., Heller Rasmus., Li Zhipeng., Wang Wen., Huang Jinghui., Li Chunyi., Qiu Qiang.(2023). A population of stem cells with strong regenerative potential discovered in deer antlers. Science, 379(6634), 840-847.(20230223,西北工业大学,邱强、王文;空军军医大学西京医院,黄景辉;长春科技学院,李春义;吉林农业大学,李志鹏

 

首次在鹿角中发现、鉴定并分离了一群具有强大骨再生潜能的干细胞群,在骨再生和骨损伤修复中具有重要的转化研究潜值。(Science | “呦呦鸣鹿”——发现鹿角再生干细胞群,为理解哺乳动物再生提供全新认知

 

4. Dong Yang., Duan Shengchang., Xia Qiuju., Liang Zhenchang., Dong Xiao., ......., Sheng Jun., Chen Wei.(2023). Dual domestications and origin of traits in grapevine evolution. Science, 379(6635), 892-901. (20230302,云南农业大学,陈玮、盛军;中国科学院植物研究所,李绍华

 

该项目聚焦葡萄起源、驯化、传播的重要科学问题和学术界一直存在争议的观点,使用超大规模基因组数据和复杂的数据分析方式,在经过3年时间,彻底解析了葡萄的起源和迁徙问题,纠正了葡萄学术界存在多个争议,形成了葡萄起源和迁徙的一致观点,改写了葡萄研究的教科书,构建了可供葡萄育种的基因组、表型大数据体系,贯穿了葡萄人工选育-改良的整个过程的研究。(Science封面 | 云南农业大学领衔解析葡萄的起源和驯化

 

5. Mao Chunyou., Xiao Peng., Tao Xiao-Na., Qin Jiao., He Qing-Tao., Zhang Chao., Guo Sheng-Chao., Du Ya-Qin., Chen Li-Nan., Shen Dan-Dan., Yang Zhi-Shuai., Zhang Han-Qiong., Huang Shen-Ming., He Yong-Hao., Cheng Jie., Zhong Ya-Ni., Shang Pan., Chen Jun., Zhang Dao-Lai., Wang Qian-Lang., Liu Mei-Xia., Li Guo-Yu., Guo Yongyuan., Xu H Eric., Wang Chuanxin., Zhang Cheng., Feng Shiqing., Yu Xiao., Zhang Yan., Sun Jin-Peng.(2023). Unsaturated bond recognition leads to biased signal in a fatty acid receptor. Science, 380(6640), eadd6220.(20230302,山东大学,孙金鹏、冯世庆、于晓;浙江大学,张岩

 

本项研究进行了系统药理学分析,结合结构生物学,计算生物学和细胞功能实验,阐明GPR120受体内的芳香族氨基酸可以通过π-π作用识别特定的双键,进而影响不同的下游信号转导。(Science丨孙金鹏/张岩/于晓/冯世庆团队揭示鱼油受体GPR120识别不饱和脂肪酸双键的分子机制

 

6. Dong Shihao., Lin Tao., Nieh James C., Tan Ken.(2023). Social signal learning of the waggle dance in honey bees. Science, 379(6636), 1015-1018.(20230309,中国科学院西双版纳热带植物园,谭垦;加州大学圣地亚哥分校,James C. Nieh)

 

社会学习改善了蜜蜂的“舞蹈语言”表达能力,幼教缺失影响蜜蜂舞蹈信息的准确性。该研究为昆虫的社会学习研究提供了一个崭新模式。

 

7. Xie Guohui., Du Xuan., Hu Hongmiao., Li Sisi., Cao Xiaofeng., Jacobsen Steven E., Du Jiamu.(2023). Structure and mechanism of the plant RNA polymerase V. Science, 379(6638), 1209-1213.(20230309,南方科技大学,杜嘉木

 

本项研究揭示了NRPE2引起的转录停顿和转录回溯增强的分子机制,提出了在RdDM通路中Pol V通过滞留在染色质上作为支架蛋白对下游作用因子进行招募,从而引起基因沉默的工作模型。(Science丨杜嘉木课题组解析植物RNA聚合酶V的结构功能机制

 

8. Zhai Yue., Chen Liang., Zhao Qian., Zheng Zhao-Hui., Chen Zhi-Nan., Bian Huijie., Yang Xu., Lu Huan-Yu., Lin Peng., Chen Xi., Chen Ruo., Sun Hao-Yang., Fan Lin-Ni., Zhang Kun., Wang Bin., Sun Xiu-Xuan., Feng Zhuan., Zhu Yu-Meng., Zhou Jian-Sheng., Chen Shi-Rui., Zhang Tao., Chen Si-Yu., Chen Jun-Jie., Zhang Kui., Wang Yan., Chang Yang., Zhang Rui., Zhang Bei., Wang Li-Juan., Li Xiao-Min., He Qian., Yang Xiang-Min., Nan Gang., Xie Rong-Hua., Yang Liu., Yang Jing-Hua., Zhu Ping.(2023). Cysteine carboxyethylation generates neoantigens to induce HLA-restricted autoimmunity. Science, 379(6637), eabg2482. (20230317,空军军医大学,朱平

 

首次发现并鉴定出一种全新的蛋白PTM——半胱氨酸羧基乙基化修饰。半胱氨酸羧乙基化修饰是体内代谢产物3-HPA引起的新型蛋白修饰形式,羧乙基化修饰的ITGA2B能够诱导AS产生修饰型新生抗原,发生特异性自身免疫反应。为攻克重大自身免疫病提供了“差异修饰蛋白—修饰型新生抗原”的系统方法策略。该研究首次揭示了自身免疫病“环境-代谢物-新修饰-新抗原”的致病新机制、新理论,为代谢物修饰形成新生抗原、诱发自身免疫病病因病理学研究奠定了至关重要的基础,并对建立AS等免疫病自身抗原特异性筛查和针对性治疗策略具有重大意义。(Science | 朱平等揭示半胱氨酸羧乙基化修饰生成新生抗原诱导HLA限制性自身免疫反应

 

9. Zhang Huili., Yu Feifei., Xie Peng., Sun Shengyuan., Qiao Xinhua., Tang Sanyuan., Chen Chengxuan., Yang Sen., Mei Cuo., Yang Dekai., Wu Yaorong., Xia Ran., Li Xu., Lu Jun., Liu Yuxi., Xie Xiaowei., Ma Dongmei., Xu Xing., Liang Zhengwei., Feng Zhonghui., Huang Xiahe., Yu Hong., Liu Guifu., Wang Yingchun., Li Jiayang., Zhang Qifa., Chen Chang., Ouyang Yidan., Xie Qi.(2023). A Gγ protein regulates alkaline sensitivity in crops. Science, 379(6638), eade8416. (20230324,中国科学院遗传与发育生物学研究所,谢旗;华中农业大学,欧阳亦聃;中国农业大学,于菲菲

 

发现一个重要的耐盐碱调控基因AT1(Alkali tolerance 1),通过对该基因的操纵,可以显著提高多种作物的盐碱耐受性,并揭示了AT1通过调节细胞中的活性氧(ROS)水平来参与碱胁迫响应的分子机理。(Science | 谢旗/于菲菲/欧阳亦聃合作团队发现一个重要耐碱基因,可大幅提高盐碱地作物产量

 

10. Tu Hai-Qing., Li Sen., Xu Yu-Ling., Zhang Yu-Cheng., Li Pei-Yao., Liang Li-Yun., Song Guang-Ping., Jian Xiao-Xiao., Wu Min., Song Zeng-Qing., Li Ting-Ting., Hu Huai-Bin., Yuan Jin-Feng., Shen Xiao-Lin., Li Jia-Ning., Han Qiu-Ying., Wang Kai., Zhang Tao., Zhou Tao., Li Ai-Ling., Zhang Xue-Min., Li Hui-Yan.(2023). Rhythmic cilia changes support SCN neuron coherence in circadian clock. Science, 380(6648), 972-979. (20230601,军事科学院军事医学研究院,李慧艳、张学敏)

 

发现大脑视交叉上核(SCN)神经元的初级纤毛是调控机体节律的细胞器,揭示出“有形”生物钟的存在及其节律调控机制。此项科学突破不仅加深了对生物钟本质的认识,也为节律紊乱相关疾病的治疗开辟了全新途径。(Science | 李慧艳/张学敏团队发现“有形”生物钟,助力人类节律紊乱性疾病治疗

 

11. Shao Yong., Zhou Long., Li Fang., Zhao Lan., Zhang Bao-Lin., Shao Feng., Chen Jia-Wei., Chen Chun-Yan., Bi Xupeng., Zhuang Xiao-Lin., Zhu Hong-Liang., Hu Jiang., Sun Zongyi., Li Xin., Wang Depeng., Rivas-González Iker., Wang Sheng., Wang Yun-Mei., Chen Wu., Li Gang., Lu Hui-Meng., Liu Yang., Kuderna Lukas F K., Farh Kyle Kai-How., Fan Peng-Fei., Yu Li., Li Ming., Liu Zhi-Jin., Tiley George P., Yoder Anne D., Roos Christian., Hayakawa Takashi., Marques-Bonet Tomas., Rogers Jeffrey., Stenson Peter D., Cooper David N., Schierup Mikkel Heide., Yao Yong-Gang., Zhang Ya-Ping., Wang Wen., Qi Xiao-Guang., Zhang Guojie., Wu Dong-Dong.(2023). Phylogenomic analyses provide insights into primate evolution. Science, 380(6648), 913-924.(20230601,昆明动物所,吴东东;浙江大学,张国捷;西北大学,齐晓光

 

推断出了灵长动物各主要类群的演化时间,并推断出所有灵长类的最近共同祖先出现在大约6829万到6495万年前,距离6550万年前的白垩纪末期大灭绝事件非常近,大致位于白垩纪的界限附近。8篇Science(国内4篇)聚焦灵长类基因组——揭示灵长类动物演化之谜

 

12. Rivas-González Iker., Rousselle Marjolaine., Li Fang., Zhou Long., Dutheil Julien Y., Munch Kasper., Shao Yong., Wu Dongdong., Schierup Mikkel H., Zhang Guojie.(2023). Pervasive incomplete lineage sorting illuminates speciation and selection in primates. Science, 380(6648), eabn4409. (20230602,浙江大学,张国捷;Aarhus University,Mikkel H. Schierup)

 

对灵长类中导致基因树和物种演化树冲突的不完全谱系分流现象进行了系统性研究。8篇Science(国内4篇)聚焦灵长类基因组——揭示灵长类动物演化之谜

 

13. Wu Hong., Wang Zefu., Zhang Yuxing., Frantz Laurent., Roos Christian., Irwin David M., Zhang Chenglin., Liu Xuefeng., Wu Dongdong., Huang Song., Gu Tongtong., Liu Jianquan., Yu Li.(2023). Hybrid origin of a primate, the gray snub-nosed monkey. Science, 380(6648), eabl4997.(20230602,云南大学,于黎;四川大学,刘健全

 

提出了黔金丝猴是由川金丝猴和滇金丝猴/怒江金丝猴共同祖先杂交后成为新的物种。8篇Science(国内4篇)聚焦灵长类基因组——揭示灵长类动物演化之谜

 

14. Qi Xiao-Guang., Wu Jinwei., Zhao Lan., Wang Lu., Guang Xuanmin., Garber Paul A., Opie Christopher., Yuan Yuan., Diao Runjie., Li Gang., Wang Kun., Pan Ruliang., Ji Weihong., Sun Hailu., Huang Zhi-Pang., Xu Chunzhong., Witarto Arief B., Jia Rui., Zhang Chi., Deng Cheng., Qiu Qiang., Zhang Guojie., Grueter Cyril C., Wu Dongdong., Li Baoguo.(2023). Adaptations to a cold climate promoted social evolution in Asian colobine primates. Science, 380(6648), eabl8621.(20230602,西北大学,李保国

 

提出了亚洲叶猴类从喜马拉雅山南麓到达东亚、东南亚地区的历史扩散路线,发现对寒冷气候的适应驱动了亚洲叶猴社会的复杂化,发现催产素通路和多巴胺通路在其中部分类群经历了快速演化,促进了亚洲叶猴从单家庭群向复杂多层社会系统的聚合,揭示了灵长类复杂社会结构的演化机制,为灵长类社会性演化提供了深入的案例研究。(8篇Science(国内4篇)聚焦灵长类基因组——揭示灵长类动物演化之谜

 

15. Liu Zhiyuan., Chen Yujie., Xia Qimin., Liu Menghan., Xu Heming., Chi Yi., Deng Yujing., Xing Dong.(2023). Linking genome structures to functions by simultaneous single-cell Hi-C and RNA-seq. Science, 380(6649), 1070-1076.(20230608,北京大学生物医学前沿创新中心,邢栋

 

报道了一种新型单细胞多组学技术HiRES(Hi-C and RNA-seq employed simultaneously),首次基于测序方法实现了在单细胞水平对转录组和三维基因组的同时检测。(Science|邢栋课题组利用单细胞多组学技术揭示三维基因组与基因表达的关系

 

16. Zhang Tao., Xu Daichao., Trefts Elijah., Lv Mingming., Inuzuka Hiroyuki., Song Guobin., Liu Min., Lu Jianlin., Liu Jianping., Chu Chen., Wang Min., Wang Huibing., Meng Huyan., Liu Hui., Zhuang Yuan., Xie Xingxing., Dang Fabin., Guan Dongxian., Men Yuqin., Jiang Shuwen., Jiang Cong., Dai Xiaoming., Liu Jing., Wang Zhen., Yan Peiqiang., Wang Jingchao., Tu Zhenbo., Babuta Mrigya., Erickson Emily., Hillis Alissandra L., Dibble Christian C., Asara John M., Szabo Gyongy., Sicinski Piotr., Miao Ji., Lee Yu-Ru., Pan Lifeng., Shaw Reuben J., Yuan Junying., Wei Wenyi.(2023). Metabolic orchestration of cell death by AMPK-mediated phosphorylation of RIPK1. Science, 380(6652), 1372-1380. (20230629,哈佛医学院,魏文毅;中科院生物与化学交叉研究中心,袁钧瑛;索尔克生物研究所,Reuben Shaw;中科院上海有机化学研究所,潘李峰;中科院生物与化学交叉研究中心,许代超

 

该研究揭示了过度能量代谢压力通过死亡受体蛋白DR4/5激活RIPK1, 并促进细胞程序性坏死发生的分子机制。(Science丨能量代谢压力诱导RIPK1激酶介导的程序性坏死和炎症的关键机制

 

17. Huang Fei., Luo Xiao., Ou Yang., Gao Zhaoxu., Tang Qiming., Chu Zhenzhen., Zhu Xinguang., He Yuehui.(2023). Control of histone demethylation by nuclear-localized α-ketoglutarate dehydrogenase. Science, 381(6654), eadf8822.(20230714,北京大学,何跃辉

 

该研究报道了三羧酸循环(TCA Cycle)的限速酶α-酮戊二酸脱氢酶复合体(α-ketoglutarate dehydrogenase,KGDH)响应光信号进入细胞核,并与JMJs蛋白互作;KGDH通过竞争性代谢α-酮戊二酸,抑制了JMJs的组蛋白去甲基化活性,从而在全基因组水平调控组蛋白的甲基化修饰进而调控一系列环境响应基因表达的分子机制。(Science | 北京大学何跃辉团队揭示核定位的α-酮戊二酸脱氢酶复合体调控组蛋白去甲基化的分子机制

 

18. Wang Kai., Zhang Zhiwei., Hang Jing., Liu Jia., Guo Fusheng., Ding Yong., Li Meng., Nie Qixing., Lin Jun., Zhuo Yingying., Sun Lulu., Luo Xi., Zhong Qihang., Ye Chuan., Yun Chuyu., Zhang Yi., Wang Jue., Bao Rui., Pang Yanli., Wang Guang., Gonzalez Frank J., Lei Xiaoguang., Qiao Jie., Jiang Changtao.(2023). Microbial-host-isozyme analyses reveal microbial DPP4 as a potential antidiabetic target. Science, 381(6657), eadd5787. (20230804,北京大学医学部基础医学院/北京大学第三医院医学创新研究院,姜长涛;北京大学第三医院,乔杰;北京大学,雷晓光;美国国立卫生研究院,Frank Gonzalez;首都医科大学朝阳医院,王广

 

首次提出了肠道菌源宿主同工酶(Microbial-host-isozyme,MHI)新概念,发现菌源宿主同工酶在肠道中的广泛存在,可以模拟宿主酶的功能,并参与疾病的发生发展。(Science丨姜长涛/乔杰/雷晓光/Frank Gonzalez/王广合作报道肠道菌群调控代谢性疾病的新角色——菌源宿主同工酶

 

19. Zhou Zijing., Ma Xiaonuo., Lin Yiechang., Cheng Delfine., Bavi Navid., Secker Genevieve A., Li Jinyuan Vero., Janbandhu Vaibhao., Sutton Drew L., Scott Hamish S., Yao Mingxi., Harvey Richard P., Harvey Natasha L., Corry Ben., Zhang Yixiao., Cox Charles D.(2023). MyoD-family inhibitor proteins act as auxiliary subunits of Piezo channels. Science, 381(6659), 799-804.(20230818,澳大利亚Victor Chang心脏研究所,Charles Cox;中科院上海有机化学研究所生物与化学交叉中心,张一小

 

首次报道了MyoD家族抑制蛋白MDFIC和MDFI是Piezo1/2的结合蛋白,作者通过结构解析和功能研究,发现MDFIC通过C末端一段高度脂质化修饰的两亲性α螺旋从侧面插向Piezo的孔道模块,并证实该α螺旋能够引起外源和内源Piezo1/2的慢失活过程。该研究鉴定了首个Piezo蛋白附属亚基,解释了在许多细胞类型中观察到的内源 Piezo 通道截然不同的门控特性,为Piezo通道功能机制的研究提供了全新的方向。(Science丨Charles Cox/张一小团队发现MDFIC是Piezo附属亚基参与机械门控调节

 

20. Wang Yuhao., Wang Meng., Chen Jiaxin., Li Yun., Kuang Zheng., Dende Chaitanya., Raj Prithvi., Quinn Gabriella., Hu Zehan., Srinivasan Tarun., Hassell Brian., Ruhn Kelly A., Behrendt Cassie L., Liang Tingbo., Dou Xiaobing., Song Zhangfa., Hooper Lora V.(2023). Snhg9The gut microbiota reprograms intestinal lipid metabolism through long noncoding RNA . Science, 381(6660), 851-857.(20230825,美国西南医学中心,Lora Hooper;浙江大学,王宇浩

 

发现了一种肠道菌群调控脂质代谢的全新机制,并首次证明了长链非编码RNA(lncRNA)在肠道菌群调控肠道脂质吸收过程中的关键作用。(Science丨王宇浩/Lora Hooper团队发现肠道菌群调控脂质代谢新机制

 

21. Liu Chao-Pei., Yu Zhenyu., Xiong Jun., Hu Jie., Song Aoqun., Ding Dongbo., Yu Cong., Yang Na., Wang Mingzhu., Yu Juan., Hou Peini., Zeng Kangning., Li Zhenyu., Zhang Zhuqiang., Zhang Xinzheng., Li Wei., Zhang Zhiguo., Zhu Bing., Li Guohong., Xu Rui-Ming.(2023). Structural insights into histone binding and nucleosome assembly by chromatin assembly factor-1. Science, 381(6660), eadd8673. (20230825,中国科学院生物物理研究所,许瑞明、李国红、朱冰

 

报道了人源染色质组装因子CAF-1、CAF-1与组蛋白H3-H4及核小体组装中间态Di-tetrasome等复合物一系列近原子分辨率三维结构,揭示了CAF-1结合组蛋白并介导右手螺旋核小体组装中间态形成的结构基础。(专家点评Science丨许瑞明/李国红/朱冰/刘超培揭示染色质组装因子CAF-1介导核小体装配的结构基础

 

22. Hu Wangjie., Hao Ziqian., Du Pengyuan., Di Vincenzo Fabio., Manzi Giorgio., Cui Jialong., Fu Yun-Xin., Pan Yi-Hsuan., Li Haipeng.(2023). Genomic inference of a severe human bottleneck during the Early to Middle Pleistocene transition.Science, 381(6661), 979-984.(20230831,中国科学院上海营养与健康研究所,李海鹏;华东师范大学,潘逸萱

 

创建了全新的群体历史估计方法,即快速极小时间溯祖(FitCoal)新理论,通过将FitCoal应用到现代人的全基因组公共测序数据,发现人类在早、中更新世过渡期由于气候环境的急剧变化经历了严重的群体瓶颈,人类祖先几乎灭绝。(专家点评Science | 李海鹏/潘逸萱联合团队采用生物信息学新方法揭示人类祖先在早、中更新世过渡期近乎灭绝

 

23. Li Yu., Liu Shaorui., Zhou Kewen., Wang Yinsheng., Chen Yan., Hu Wen., Li Shuyan., Li Hui., Wang Yan., Wang Qiuying., He Danyang., Xu Heping.(2023). Neuromedin U programs eosinophils to promote mucosal immunity of the small intestine. Science, 381(6663), 1189-1196.(20230914,西湖大学,徐和平

 

揭示了肠道神经系统信号可通过调控嗜酸性粒细胞的活性进而调节小肠上皮细胞稳态和粘膜免疫力。(Science丨徐和平课题组发现嗜酸性粒细胞介导神经肽NMU调节小肠粘膜免疫力

 

24. Jiang Yanyou., Cao Tianjun., Yang Yuqing., Zhang Huan., Zhang Jingyu., Li Xiaobo.(2023). A chlorophyll  synthase widely co-opted by phytoplankton. Science, 382(6666), 92-98.(20231005,西湖大学,李小波

 

首次报道了叶绿素c合成酶编码基因及该酶作用机制,挖掘了叶绿素c的生理功能,讨论了该基因的演化形成与转移。这项研究解决了长期以来困扰海洋光合作用领域的一个问题,并为海洋藻类捕光机制的合成生物学应用打开了一扇门。(Science | 李小波团队发现海洋光合作用关键色素合成酶

 

25. Wang Huan., Qian Tongrui., Zhao Yulin., Zhuo Yizhou., Wu Chunling., Osakada Takuya., Chen Peng., Chen Zijun., Ren Huixia., Yan Yuqi., Geng Lan., Fu Shengwei., Mei Long., Li Guochuan., Wu Ling., Jiang Yiwen., Qian Weiran., Zhang Li., Peng Wanling., Xu Min., Hu Ji., Jiang Man., Chen Liangyi., Tang Chao., Zhu Yingjie., Lin Dayu., Zhou Jiang-Ning., Li Yulong.(2023). A tool kit of highly selective and sensitive genetically encoded neuropeptide sensors. Science, 382(6672), eabq8173. (20231117,北京大学,李毓龙

 

报道了一种利用包含荧光报告模块的第三胞内环(Intracellular loop 3, ICL3)嫁接的策略,高效可通用地开发了一系列神经肽荧光探针工具包。(Science | 移花接木——李毓龙实验室设计通用型嫁接策略开发神经肽探针工具包

 

26. Yang Ning., Wang Yuebin., Liu Xiangguo., Jin Minliang., Vallebueno-Estrada Miguel., Calfee Erin., Chen Lu., Dilkes Brian P., Gui Songtao., Fan Xingming., Harper Thomas K., Kennett Douglas J., Li Wenqiang., Lu Yanli., Ding Junqiang., Chen Ziqi., Luo Jingyun., Mambakkam Sowmya., Menon Mitra., Snodgrass Samantha., Veller Carl., Wu Shenshen., Wu Siying., Zhuo Lin., Xiao Yingjie., Yang Xiaohong., Stitzer Michelle C., Runcie Daniel., Yan Jianbing., Ross-Ibarra Jeffrey.(2023). Two teosintes made modern maize. Science, 382(6674), eadg8940.(20231201,华中农业大学,杨宁、严建兵;美国加州大学戴维斯分校,Jeffrey Ross-Ibarra)

 

利用迄今为止数据量最大的传统玉米测序数据开展群体遗传分析,揭示了所有现代玉米都可以追溯到驯化的古玉米和Zea mays ssp.mexicana之间的古混合事件,重塑了玉米起源模型。这项研究成果不仅解决了长期以来备受争议的现代玉米起源问题,还强调了基于作物野生近缘物种改良玉米农艺性状的应用潜力。(玉米起源进化的“世纪之争”——技术进步和学科交叉如何解决重大科学问题

 

27. Yan Pengshuai., Du Qingguo., Chen Huan., Guo Zifeng., Wang Zhonghua., Tang Jihua., Li Wen-Xue.(2023). Biofortification of iron content by regulating a NAC transcription factor in maize. Science, 382(6675), 1159-1165.(20231207,中国农科院作科所,李文学;河南农业大学,汤继华

 

该研究鉴定到调控铁进入玉米籽粒的关键基因ZmNAC78,首次解析了该基因和金属转运蛋白共同组成一个分子开关控制铁元素进入玉米籽粒的分子机制。(Science | 中国农科院作科所联合河南农大发现玉米籽粒铁转运关键分子开关,助力解决铁缺乏引起的“隐性饥饿”

 

28. Li Lijia., Lai Fangnong., Hu Xiaoyu., Liu Bofeng., Lu Xukun., Lin Zili., Liu Ling., Xiang Yunlong., Frum Tristan., Halbisen Michael A., Chen Fengling., Fan Qiang., Ralston Amy., Xie Wei.(2023). Multifaceted SOX2-chromatin interaction underpins pluripotency progression in early embryos. Science, 382(6676), eadi5516.(20231215,清华大学,颉伟

 

报道了多能性先锋因子SOX2在哺乳动物早期胚胎多能性建立和转换过程中的调控机制。揭示了体内发育多能性程序的调控机制和先锋因子的工作机制,为更好地理解多能性和细胞命运的调控,以及体内体外多能性研究模型奠定了基础。(Science丨颉伟组揭示早期胚胎先锋转录因子调控多能性程序的分子机制

 

29. Chen Xizi., Liu Weida., Wang Qianmin., Wang Xinxin., Ren Yulei., Qu Xuechun., Li Wanjun., Xu Yanhui.(2023). Structural visualization of transcription initiation in action. Science, 382(6677), eadi5120.(20231222,复旦大学,徐彦辉)

 

该项研究首次用结构重现出了转录从头起始的16个连续动态全过程,揭示了通用转录因子(GTFs)和转录泡协同RNA聚合酶Pol II调控转录起始向转录延伸转变的分子机制。(Science专家点评丨玉汝成,功不唐捐——徐彦辉团队揭示转录起始连续动态全过程)
30.Sang, Q., P. F. Ray and L. Wang* (2023). Understanding the genetics of human infertility. Science 380(6641): 158-163.(20230413,复旦大学,王磊,特邀综述)Science生殖专刊丨王磊/桑庆受邀撰写不孕不育遗传学研究综述
2023年Nature
(研究性文章50篇,1篇古生物学论文)
 
1. You Linlin., Omollo Expery O., Yu Chengzhi., Mooney Rachel A., Shi Jing., Shen Liqiang., Wu Xiaoxian., Wen Aijia., He Dingwei., Zeng Yuan., Feng Yu., Landick Robert., Zhang Yu.(2023). Structural basis for intrinsic transcription termination. Nature, 613(7945), 783-789.(20230111,国科学院分子植物科学卓越创新中心,张余;美国威斯康辛大学麦迪逊分校,Robert Landick;浙江大学,冯钰

 

该研究捕获了细菌固有转录终止的中间状态冷冻电镜结构,揭示了细菌RNA聚合酶识别终止序列、停止转录、并解离RNA的分子机制。(Nature | 张余/Robert Landick/冯钰合作揭示细菌固有转录终止的结构基础

 

2. Huang Jiabao., Yang Lin., Yang Liu., Wu Xiaoyu., Cui Xiaoshuang., Zhang Lili., Hui Jiyun., Zhao Yumei., Yang Hongmin., Liu Shangjia., Xu Quanling., Pang Maoxuan., Guo Xinping., Cao Yunyun., Chen Yu., Ren Xinru., Lv Jinzhi., Yu Jianqiang., Ding Junyi., Xu Gang., Wang Nian., Wei Xiaochun., Lin Qinghui., Yuan Yuxiang., Zhang Xiaowei., Ma Chaozhi., Dai Cheng., Wang Pengwei., Wang Yongchao., Cheng Fei., Zeng Weiqing., Palanivelu Ravishankar., Wu Hen-Ming., Zhang Xiansheng., Cheung Alice Y., Duan Qiaohong.(2023). Stigma receptors control intraspecies and interspecies barriers in Brassicaceae. Nature, 614(7947), 303-308. (20230125,山东农业大学,段巧红;马萨诸塞大学,Alice Y. Cheung)

 

揭示了大白菜等十字花科蔬菜通过调控柱头活性氧水平以维持种间生殖隔离的分子机理,并研发了打破远缘杂交生殖隔离的育种技术,成功获得了大白菜的种间、属间远缘杂交胚,开辟了远缘杂交育种的新思路和新途径。(Nature | 山东农业大学段巧红团队解析植物生殖隔离形成新机理,助力远缘杂交育种

 

3. Liu Hao., Li Anjie., Rochaix Jean-David., Liu Zhenfeng.(2023). Architecture of chloroplast TOC-TIC translocon supercomplex. Nature, 615(7951), 349-357.(20230126,中国科学院生物物理研究所,柳振峰

 

通过解析莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)来源的TOC-TIC超分子复合体的冷冻电镜结构,发现并定位了组成该复合体的13个不同蛋白亚基。

 

4. Shan Lin., Xu Guang., Yao Run-Wen., Luan Peng-Fei., Huang Youkui., Zhang Pei-Hong., Pan Yu-Hang., Zhang Lin., Gao Xiang., Li Ying., Cao Shi-Meng., Gao Shuai-Xin., Yang Zheng-Hu., Li Siqi., Yang Liang-Zhong., Wang Ying., Wong Catharine C L., Yu Li., Li Jinsong., Yang Li., Chen Ling-Ling.(2023). Nucleolar URB1 ensures 3' ETS rRNA removal to prevent exosome surveillance. Nature, 615(7952), 526-534.(20230308,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心,陈玲玲

 

利用超高分辨率生物成像、单分子RNA成像、RNA二级结构解析以及动物模型等多种研究手段,全面揭示了核仁精细结构与pre-rRNA的加工相互协同,共同维持核仁内微环境稳定,为认识核仁功能提供了全新的见解。此外,该研究证明了URB1这类非流动性蛋白质在核仁液-液相分离环境中的关键组织作用,对深入理解三维pre-rRNA加工机制、核仁组装形成和功能提供了新的思路。(Nature | 陈玲玲团队揭示核仁的超微精细结构——非流动性蛋白URB1在核仁液-液相分离环境中的关键组织作用

 

5. Yang Jie., Lan Tian., Zhang Xi-Guang., Smith Martin R.(2023). Protomelission is an early dasyclad alga and not a Cambrian bryozoan. Nature, 615(7952), 468-471.(20230308,云南大学,张喜光;英国杜伦大学,Martin Smith)

 

研究结果表明目前尚未发现明确的寒武纪时期的苔藓动物化石。

 

6. You Xin., Zhang Xing., Cheng Jing., Xiao Yanan., Ma Jianfei., Sun Shan., Zhang Xinzheng., Wang Hong-Wei., Sui Sen-Fang.(2023). In situ structure of the red algal phycobilisome-PSII-PSI-LHC megacomplex. Nature, 616(7955), 199-206.(20230315,清华大学,隋森芳、王宏伟;中科院生物物理研究所,章新政

 

为阐明细胞内天然状态下 PBS-PSII-PSI-LHC超大复合体的组装机制,以及能量从PBS 向PSII和PSI的高效转移的机制奠定了坚实的结构基础,是光合领域里的一个里程碑成果。(Nature | 隋森芳/王宏伟/章新政报道首个藻胆体-光系统II-光系统I-捕光复合物超大复合体的细胞原位3.3 Å三维结构

 

7. Hu Xinlin., Yang Ping., Chai Changdong., Liu Jia., Sun Huanhuan., Wu Yanan., Zhang Mingjie., Zhang Min., Liu Xiaotian., Yu Hongjun.(2023). Structural and mechanistic insights into fungal β-1,3-glucan synthase FKS1. Nature, 616(7955), 190-198.(20230322,华中科技大学同济基础医学院,于洪军、张敏;南方科技大学生命科学院,刘晓天

 

解开了困扰领域多年的抗真菌药物重要靶点-真菌细胞壁β-1,3-葡聚糖的合成及其靶向药物的耐药产生机制之谜,对于应对侵袭性真菌感染这一临床问题具有重要科学意义。(专家点评Nature | 于洪军/刘晓天/张敏揭示真菌细胞壁β-1,3-葡聚糖合成的分子基础和棘白菌素类抗真菌药物的耐药产生机制

 

8. Li Yaxin., Shen Hao., Zhang Ruixue., Ji Chenggong., Wang Yuxin., Su Chen., Xiao Junyu.(2023). Immunoglobulin M perception by FcμR. Nature, 615(7954), 907-912.(20230322,北京大学,肖俊宇

 

该研究通过结构生物学、生物化学和细胞生物学等手段揭示了FcμR特异性感知不同形式IgM的分子机制,为深入理解IgM的生物学功能奠定了基础。(Nature | 肖俊宇研究组阐明免疫球蛋白IgM被特异性受体FcμR识别的分子机制

 

9. Ge Weiran., Yu Cong., Li Jingjing., Yu Zhenyu., Li Xiaorong., Zhang Yan., Liu Chao-Pei., Li Yingfeng., Tian Changlin., Zhang Xinzheng., Li Guohong., Zhu Bing., Xu Rui-Ming.(2023). Basis of the H2AK119 specificity of the Polycomb repressive deubiquitinase. Nature, 616(7955).(20230329,中国科学院生物物理研究所,许瑞明、朱冰

 

报道了人源PR-DUB复合物结合H2AK119泛素化核小体的高分辨率电镜结构,揭示了PR-DUB特异性去除核小体H2AK119泛素化修饰的分子机理。(Nature | 许瑞明/朱冰课题组合作揭示去泛素化酶PR-DUB特异性去除核小体H2AK119泛素化的分子机制

 

10. Zhong Xiu., Zeng Huan., Zhou Zhiwei., Su Ya., Cheng Hang., Hou Yanjie., She Yang., Feng Na., Wang Jia., Shao Feng., Ding Jingjin.(2023). Structural mechanisms for regulation of GSDMB pore-forming activity. Nature, 616(7957), 598-605.(20230329,中科院生物物理研究所,丁璟珒;北京生命科学研究所,邵峰

 

揭示了IpaH7.8特异性识别GSDMB和GSDMD两种焦亡蛋白的结构基础,破解了GSDMB可变剪接调控细胞焦亡活性的精确分子机理。(Nature背靠背 | 丁璟珒/邵峰团队合作揭示GSDMB膜打孔介导细胞焦亡的结构基础和调控机制

 

11. Liu William J., Liu Peipei., Lei Wenwen., Jia Zhiyuan., He Xiaozhou., Shi Weifeng., Tan Yun., Zou Shumei., Wong Gary., Wang Ji., Wang Feng., Wang Gang., Qin Kun., Gao Rongbao., Zhang Jie., Li Min., Xiao Wenling., Guo Yuanyuan., Xu Ziqian., Zhao Yingze., Song Jingdong., Zhang Jing., Zhen Wei., Zhou Wenting., Ye Beiwei., Song Juan., Yang Mengjie., Zhou Weimin., Dai Yuting., Lu Gang., Bi Yuhai., Tan Wenjie., Han Jun., Gao George F., Wu Guizhen.(2023). Surveillance of SARS-CoV-2 at the Huanan Seafood Market. Nature.(20230405,中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所,武桂珍、高福、刘军

 

该研究介绍了2020年初在中国武汉华南海鲜市场对新冠病毒(SARS-CoV-2)的监测结果。对该市场环境和动物样本的分析发现,环境拭子中监测到了新冠病毒。尽管这些发现支持了新冠病毒在新冠疫情早期曾在华南海鲜市场传播的说法,但无法证明在这种情况下病毒可能从动物传染到人类身上。

 

12. Song Long., Liu Jie., Cao Beilu., Liu Bin., Zhang Xiaoping., Chen Zhaoyan., Dong Chaoqun., Liu Xiangqing., Zhang Zhaoheng., Wang Wenxi., Chai Lingling., Liu Jing., Zhu Jun., Cui Shubin., He Fei., Peng Huiru., Hu Zhaorong., Su Zhenqi., Guo Weilong., Xin Mingming., Yao Yingyin., Yan Yong., Song Yinming., Bai Guihua., Sun Qixin., Ni Zhongfu.(2023). Reducing brassinosteroid signalling enhances grain yield in semi-dwarf wheat. Nature, 617(7959), 118-124.(20230426,中国农业大学,倪中福

 

过多年大规模田间表型调查和遗传学研究,鉴定到一个显著提升小麦群体产量的关键位点,为高产高效半矮秆小麦新品种培育提供了重要基因资源和新的育种策略。这项研究还鉴定到一个油菜素内酯(Brassinosteroid, BR)信号转导的关键正调控因子ZnF,在理论上加深了对BR信号途径的认识。(Nature | 中国农业大学小麦研究中心揭示BR与GA激素平衡调控小麦株型和产量的新机制

 

13. Shen Chongrong., Chang Shenghai., Luo Qinghua., Chan Kevin Chun., Zhang Zhibo., Luo Bingnan., Xie Teng., Lu Guangwen., Zhu Xiaofeng., Wei Xiawei., Dong Changjiang., Zhou Ruhong., Zhang Xing., Tang Xiaodi., Dong Haohao.(2023). Structural basis of BAM-mediated outer membrane β-barrel protein assembly. Nature, 617(7959), 185-193.(20230426,四川大学华西医院,董浩浩、唐晓迪;浙江大学,张兴、周如鸿

 

首次捕捉到了BAM与底物 β-桶蛋白 EspP 在外膜折叠整合过程中的多个中间态构象,同时通过体内外功能分析及全原子分子动力学模拟揭示了底物OMP的组装、关闭及释放的全过程,为以此蛋白复合物为靶点的新型抗菌药物研发提供了重要基础。(专家点评Nature | 董浩浩/唐晓迪/张兴/周如鸿合作揭示革兰氏阴性菌外膜桶蛋白的组装及完成机制

 

14. Zhang He., Zhang Liang., Lin Ang., Xu Congcong., Li Ziyu., Liu Kaibo., Liu Boxiang., Ma Xiaopin., Zhao Fanfan., Jiang Huiling., Chen Chunxiu., Shen Haifa., Li Hangwen., Mathews David H., Zhang Yujian., Huang Liang.(2023). Algorithm for optimized mRNA design improves stability and immunogenicity.Nature, 621(7978), 396-403.(20230502,百度美国研究院,Liang Huang;斯微(上海)生物科技股份有限公司,Yujian Zhang、Hangwen Li;罗切斯特大学,David H. Mathews)

 

作者开发了专门用于设计 mRNA 序列的高效AI算法LinearDesign,将自然语言处理领域中的lattice parsing(网格解析)结合到计算生物领域,将找到最佳mRNA序列模拟为在相似发音的替代方案中识别最可能的句子,同时优化结构稳定性和密码子的使用,能够迅速设计出更稳定更有效的mRNA序列。

 

15. Guo Lulu., Cheng Jie., Lian Shuo., Liu Qun., Lu Yan., Zheng Yuan., Zhu Kongkai., Zhang Minghui., Kong Yalei., Zhang Chao., Rong Naikang., Zhuang Yuming., Fang Guoxing., Jiang Jingjing., Zhang Tianyao., Han Xiang., Liu Zili., Xia Ming., Liu Shangming., Zhang Lei., Liberles Stephen D., Yu Xiao., Xu Yunfei., Yang Fan., Li Qian., Sun Jin-Peng.(2023). Structural basis of amine odorant perception by a mammal olfactory receptor. Nature, 618(7963), 193-200.(20230524,山东大学/北京大学,孙金鹏;上海交通大学医学院,李乾

 

聚焦II类嗅觉受体TAAR家族识别配体的分子和结构机制。(专家点评Nature | 孙金鹏/李乾团队合作揭示了嗅觉感知的分子机制

 

16. Li Zongqiang., Chen Shuaijiabin., Zhao Liang., Huang Guoqiang., Xu Huiqin., Yang Xiaoyun., Wang Peiyi., Gao Ning., Sui Sen-Fang.(2023). Nuclear export of pre-60S particles through the nuclear pore complex. Nature, 618(7964), 411-418.(20230531,清华大学/南方科技大学,隋森芳)

 

展示了pre-60S通过NPC孔道过程中构象和组成变化,阐述了NPC协助pre-60S进行出核转运的分子机制,为进一步理解NPC转运生物大分子的生理功能提供了重要的理论依据。(Nature | 隋森芳团队揭示核孔复合体转运核糖体前体的分子机制

 

17. Chen Lingfeng., Fu Lili., Sun Jingchuan., Huang Zhiqiang., Fang Mingzhen., Zinkle Allen., Liu Xin., Lu Junliang., Pan Zixiang., Wang Yang., Liang Guang., Li Xiaokun., Chen Gaozhi., Mohammadi Moosa.(2023). Structural basis for FGF hormone signalling. Nature, 618(7966), 862-870.(20230607,温州医科大学,李校堃、陈高帜、穆萨·穆罕默迪)

 

揭示了Klotho蛋白和HS作为共受体协同介导内分泌FGF结合FGFR形成不对称1:2 FGF–FGFR二聚体从而激活下游信号通路的分子机制。该研究首次清晰的展示了Klotho蛋白及HS在FGF23相关信号传导过程中的共受体作用机制,为糖尿病,慢性肾病等代谢性疾病的药物研发提供了重要的结构信息。(Nature | 李校堃/陈高帜/穆萨·穆罕默迪团队发现FGF信号激活全新范式

 

18. Guo Jianping., Wang Huiying., Guan Wei., Guo Qin., Wang Jing., Yang Jing., Peng Yaxin., Shan Junhan., Gao Mingyang., Shi Shaojie., Shangguan Xinxin., Liu Bingfang., Jing Shengli., Zhang Jing., Xu Chunxue., Huang Jin., Rao Weiwei., Zheng Xiaohong., Wu Di., Zhou Cong., Du Bo., Chen Rongzhi., Zhu Lili., Zhu Yuxian., Walling Linda L., Zhang Qifa., He Guangcun.(2023). A tripartite rheostat controls self-regulated host plant resistance to insects. Nature, 618(7966), 799-807.(20230614,武汉大学,何光存

 

该研究发现了首个被植物抗虫蛋白识别并激活抗性反应的昆虫效应子,并揭示了BISP-BPH14-OsNBR1互作系统精细调控抗性-生长平衡的新机制,为开发高产、抗虫水稻品种提供了重大理论和应用基础,也为其它粮食作物新型抗虫、抗病机理的研究提供了新思路。(Nature | 武汉大学何光存团队揭示BISP-BPH14-OsNBR1精细调控植物抗性—生长平衡的新机制

 

19. Sha Gan., Sun Peng., Kong Xiaojing., Han Xinyu., Sun Qiping., Fouillen Laetitia., Zhao Juan., Li Yun., Yang Lei., Wang Yin., Gong Qiuwen., Zhou Yaru., Zhou Wenqing., Jain Rashmi., Gao Jie., Huang Renliang., Chen Xiaoyang., Zheng Lu., Zhang Wanying., Qin Ziting., Zhou Qi., Zeng Qingdong., Xie Kabin., Xu Jiandi., Chiu Tsan-Yu., Guo Liang., Mortimer Jenny C., Boutté Yohann., Li Qiang., Kang Zhensheng., Ronald Pamela C., Li Guotian.(2023). Genome editing of a rice CDP-DAG synthase confers multipathogen resistance.Nature, 618(7967), 1017-1023.(20230614,华中农业大学,李国田;美国加州大学戴维斯分校,Pamela C. Ronald)

 

该研究将人工诱变技术与全基因组测序技术相结合,成功克隆水稻广谱抗病的关键调控基因RBL1,并通过基因编辑创制了新型水稻广谱抗病材料。(专家点评Nature | 华中农业大学李国田团队牵头创制新型作物广谱抗病基因

 

20. Gao Yang., Yang Xiaofei., Chen Hao., Tan Xinjiang., Yang Zhaoqing., Deng Lian., Wang Baonan., Kong Shuang., Li Songyang., Cui Yuhang., Lei Chang., Wang Yimin., Pan Yuwen., Ma Sen., Sun Hao., Zhao Xiaohan., Shi Yingbing., Yang Ziyi., Wu Dongdong., Wu Shaoyuan., Zhao Xingming., Shi Binyin., Jin Li., Hu Zhibin.,  Chinese Pangenome Consortium (CPC)., Lu Yan., Chu Jiayou., Ye Kai., Xu Shuhua.(2023). A pangenome reference of 36 Chinese populations. Nature, 619(7968), 112-121.(20230614,复旦大学,徐书华、陆艳;西安交通大学,叶凯;中国医学科学院,褚嘉祐

 

发布了中国人群泛基因组联盟(CPC)一期研究进展。(专家点评Nature | “中国人群泛基因组联盟”发布一期研究进展

 

21. Kang Yunlu., Chen Lei.(2023). Structural basis for the binding of DNP and purine nucleotides onto UCP1. Nature, 620(7972), 226-231.(20230619,北京大学,陈雷

 

报道了人源UCP1处于无核苷酸结合、DNP结合以及ATP结合三种状态的高分辨率冷冻电镜结构。(Nature | 陈雷组报道人源UCP1识别小分子抑制剂和激活剂的机制

 

22. Song Xinyang., Zhang Haohao., Zhang Yanbo., Goh Byoungsook., Bao Bin., Mello Suelen S., Sun Ximei., Zheng Wen., Gazzaniga Francesca S., Wu Meng., Qu Fangfang., Yin Qiangzong., Gilmore Michael S., Oh Sungwhan F., Kasper Dennis L.(2023). Gut microbial fatty acid isomerization modulates intraepithelial T cells. Nature, 619(7971), 837-843.(20230628,中科院分子细胞科学卓越创新中心,宋昕阳;美国哈佛医学院,Dennis L. Kasper)

 

该研究揭示了共生微生物长链脂肪酸异构化反应调控小肠上皮间淋巴细胞(Intraepithelial lymphocytes, IELs)稳态的新机制。(Nature | 宋昕阳等揭示共生微生物长链脂肪酸代谢物调控肠道上皮间淋巴细胞的新机制

 

23. Liang Liang., Cao Changchang., Ji Lei., Cai Zhaokui., Wang Di., Ye Rong., Chen Juan., Yu Xiaohua., Zhou Jie., Bai Zhibo., Wang Ruoyan., Yang Xianguang., Zhu Ping., Xue Yuanchao.(2023). Complementary Alu sequences mediate enhancer-promoter selectivity. Nature, 619(7971), 868-875.(20230712,中国科学院生物物理研究所,薛愿超

 

该研究基于RIC-seq技术系统构建了涵盖7种人源细胞系的增强子-启动子RNA互作(EPRI)图谱,并首次揭示了基因组重复元件Alu序列在增强子-启动子配对选择特异性中的关键作用,为深入理解基因转录调控的分子机制提供了新见解。此外,该研究团队还对535,404个非编码突变进行了系统地注释,构建了“突变-功能”图谱,为精准医学和疾病研究提供了重要资源。(Nature | 薛愿超团队揭示基因组重复元件Alu调控转录新机制

 

24. Ji Shuyan., Chen Fengling., Stein Paula., Wang Jiacheng., Zhou Ziming., Wang Lijuan., Zhao Qing., Lin Zili., Liu Bofeng., Xu Kai., Lai Fangnong., Xiong Zhuqing., Hu Xiaoyu., Kong Tianxiang., Kong Feng., Huang Bo., Wang Qiujun., Xu Qianhua., Fan Qiang., Liu Ling., Williams Carmen J., Schultz Richard M., Xie Wei.(2023). OBOX regulates mouse zygotic genome activation and early development. Nature, 620(7976), 1047-1053.(20230717,清华大学,颉伟;宾夕法尼亚大学,Richard M. Schultz)

 

该研究发现OBOX家族是调控小鼠合子基因组激活的关键转录因子,为哺乳动物合子基因组领域研究提供了新的研究方向,是该领域里的重要突破。(Nature | 生命是如何启动的?颉伟/Richard Schultz团队揭示小鼠合子基因组启动关键转录因子

 

25. Guan Haipeng., Wang Pei., Zhang Pei., Ruan Chun., Ou Yutian., Peng Bo., Zheng Xiangdong., Lei Jianlin., Li Bing., Yan Chuangye., Li Haitao.(2023). Diverse modes of H3K36me3-guided nucleosomal deacetylation by Rpd3S. Nature, 620(7974), 669-675.(20230719,清华大学,李海涛、闫创业

 

该研究通过多肽分段化学连接手段构建多修饰核小体作为底物,利用单颗粒冷冻电镜技术解析了酿酒酵母Rpd3S复合物在自由状态和结合H3K36me3核小体状态下的分子结构模型,并利用去乙酰化酶活等生化技术和酵母遗传学等功能实验,系统全面的对Rpd3S复合物分子组装模式、底物识别催化和修饰引导调控等过程进行了解剖,揭示了Rpd3S多价核小体结合和组蛋白修饰引导的去乙酰化的动态和多样化模型,凸显了表观遗传调控的精妙复杂性,以及在转录和其他领域中大自然精心设计的多亚基复合物酶调控机制。(Nature | 李海涛/闫创业合作团队揭示H3K36me3引导下Rpd3S的核小体去乙酰化动态调控模型

 

26. Zhao Li-Hua., He Qian., Yuan Qingning., Gu Yimin., He Xinheng., Shan Hong., Li Junrui., Wang Kai., Li Yang., Hu Wen., Wu Kai., Shen Jianhua., Xu H Eric.(2023). Conserved class B GPCR activation by a biased intracellular agonist. Nature, 621(7979), 635-641.(20230731,中科院上海药物所,徐华强、赵丽华

 

发现了B类GPCRs的新型小分子激动剂结合口袋,由于该结合口袋在B类GPCRs中具有较高的保守性,并且能够激活多种受体,这为研发针对该口袋的小分子激动剂提供了新的可能性。(Nature | 徐华强/赵丽华团队揭示B类GPCRs的新型小分子药物靶点的偏向性激活机制

 

27. Duan Jia., Liu Heng., Zhao Fenghui., Yuan Qingning., Ji Yujie., Cai Xiaoqing., He Xinheng., Li Xinzhu., Li Junrui., Wu Kai., Gao Tianyu., Zhu Shengnan., Lin Shi., Wang Ming-Wei., Cheng Xi., Yin Wanchao., Jiang Yi., Yang Dehua., Xu H Eric.(2023). GPCR activation and GRK2 assembly by a biased intracellular agonist. Nature, 620(7974), 676-681.(20230802,中国科学院上海药物研究所,徐华强、段佳、杨德华

 

报道了第一个高分辨率GPCR——神经降压素受体(neurotensin receptor 1,NTSR1)与GRK2的复合物结构,揭示了GRK2识别和调控GPCR的详细分子机制,并通过结构解析,首次发现了一个全新的GPCR偏向性配体结合口袋,为临床开发靶向GPCR的偏向性药物分子开辟了全新的思路和途径。(专家点评Nature | 徐华强/段佳/杨德华团队破解GPCRs的激酶招募及偏向性信号转导机制

 

28. Chen Kun., Zhang Chenhui., Lin Shuling., Yan Xinyu., Cai Heng., Yi Cuiying., Ma Limin., Chu Xiaojing., Liu Yuchen., Zhu Ya., Han Shuo., Zhao Qiang., Wu Beili.(2023). Tail engagement of arrestin at the glucagon receptor.Nature, 620(7975), 904-910.(20230809,中国科学院上海药物研究所,吴蓓丽、赵强

 

揭示了arrestin的全新“tail”结合模式,并第一次阐明B类GPCR与arrestin的精细作用机制,在原子水平揭示受体内化及囊泡内信号转导的分子基础,极大地促进了对于B类受体信号转导机制的深入理解。(Nature | 吴蓓丽/赵强解析B类GPCR与Arrestin复合物结构揭示信号转导新机制

 

29. Xu Congling., Li Chengyu., Chen Jiwei., Xiong Yan., Qiao Zhibin., Fan Pengyu., Li Conghui., Ma Shuangyu., Liu Jin., Song Aixia., Tao Bolin., Xu Tao., Xu Wei., Chi Yayun., Xue Jingyan., Wang Pu., Ye Dan., Gu Hongzhou., Zhang Peng., Wang Qiong., Xiao Ruijing., Cheng Jingdong., Zheng Hai., Yu Xiaoli., Zhang Zhen., Wu Jiong., Liang Kaiwei., Liu Yan-Jun., Lu Huasong., Chen Fei Xavier.(2023). R-loop-dependent promoter-proximal termination ensures genome stability. Nature, 621(7979), 610-619.(20230809,复旦大学,陈飞;浙江大学,陆华松

 

该研究首次发现了INTAC复合物与单链DNA识别复合物SOSS稳定结合并形成SOSS-INTAC复合物;该复合物以聚集体的形式通过调控细胞内R-loop的水平维持基因组稳定性。(Nature | 陈飞/陆华松团队合作揭示转录与基因组稳定性“双重质控”新机制

 

30. Wang Chaoxiong., Zheng Xichen., Zhang Jinlan., Jiang Xiaoyi., Wang Jia., Li Yuwei., Li Xiaonan., Shen Guanghui., Peng Jiayin., Zheng Peixuan., Gu Yunqing., Chen Jiaojiao., Lin Moubin., Deng Changwen., Gao Hai., Lu Zhigang., Zhao Yun., Luo Min.(2023). CD300ld on neutrophils is required for tumour-driven immune suppression. Nature, 621(7980), 830-839.(20230906,复旦大学,罗敏、卢智刚、高海;中国科学院分子细胞科学卓越创新中心,赵允

 

发现一个全新的、功能高度保守的肿瘤免疫抑制受体CD300ld。CD300ld在PMN-MDSCs上特异性高表达,是调控PMN-MDSCs募集及免疫抑制功能的关键受体。靶向CD300ld能够通过抑制 PMN-MDSCs的募集和功能,重塑肿瘤免疫微环境,从而产生广谱抗肿瘤效果。(Nature | 罗敏/赵允/卢智刚/高海研究组报道靶向PMN-MDSCs的全新肿瘤免疫治疗靶点

 

31. Yuan Linjie., Ma Xianqiang., Yang Yunyun., Qu Yingying., Li Xin., Zhu Xiaoyu., Ma Weiwei., Duan Jianxin., Xue Jing., Yang Haoyu., Huang Jian-Wen., Yi Simin., Zhang Mengting., Cai Ningning., Zhang Lin., Ding Qingyang., Lai Kecheng., Liu Chang., Zhang Lilan., Liu Xinyi., Yao Yirong., Zhou Shuqi., Li Xian., Shen Panpan., Chang Qing., Malwal Satish R., He Yuan., Li Wenqi., Chen Chunlai., Chen Chun-Chi., Oldfield Eric., Guo Rey-Ting., Zhang Yonghui.(2023). Phosphoantigens glue butyrophilin 3A1 and 2A1 to activate Vγ9Vδ2 T cells. Nature, 621(7980), 840-848.(20230906,清华大学,张永辉;湖北大学,郭瑞庭

 

这项研究揭示了基于γδ T细胞的TCR-T细胞疗法的快速路径,即可以通过一种药物分子替代磷抗原,实现分子胶水的功能,使得γδ TCR能够高效地识别和攻击肿瘤细胞和感染细胞。(Nature | 张永辉/郭瑞庭揭示γδ T细胞免疫识别奥秘

 

32. Duan Yinkai., Zhou Hao., Liu Xiang., Iketani Sho., Lin Mengmeng., Zhang Xiaoyu., Bian Qucheng., Wang Haofeng., Sun Haoran., Hong Seo Jung., Culbertson Bruce., Mohri Hiroshi., Luck Maria I., Zhu Yan., Liu Xiaoce., Lu Yuchi., Yang Xiuna., Yang Kailin., Sabo Yosef., Chavez Alejandro., Goff Stephen P., Rao Zihe., Ho David D., Yang Haitao.(2023). Molecular mechanisms of SARS-CoV-2 resistance to nirmatrelvir. Nature, 622(7982), 376-382.(20230911,上海科技大学,杨海涛;哥伦比亚大学,何大一

 

揭示了新冠病毒如何利用两种截然不同的途径对治疗药物产生耐药性的分子机制。(Nature | 杨海涛/何大一团队揭示新冠病毒耐药的分子机制

 

33. Peng Qi., Yuan Bin., Cheng Jinlong., Wang Min., Gao Siwei., Bai Suran., Zhao Xuejin., Qi Jianxun., Gao George F., Shi Yi.(2023). Molecular mechanism of de novo replication by the Ebola virus polymerase. Nature, 622(7983), 603-610.(20230912,中国科学院微生物研究所,施一、高福、齐建勋

 

报道了第一个L蛋白识别基因组启动元件机制的结构。在EBOV中, L-VP35复合物是发挥高效RNA聚合活性的基本功能单元,结合冷冻电镜,研究者解析了EBOV L-VP35复合物的整体结构,同时清楚地揭示了与辅因子VP35四聚体紧密相互作用的L蛋白活性位点的结构特征。

 

34. Gong Qian., Wang Yunjing., He Linfang., Huang Fan., Zhang Danfeng., Wang Yan., Wei Xiang., Han Meng., Deng Haiteng., Luo Lan., Cui Feng., Hong Yiguo., Liu Yule.(2023). Molecular basis of methyl-salicylate-mediated plant airborne defence. Nature, 622(7981), 139-148.(20230913,清华大学,刘玉乐

 

该工作鉴定了识别气态MeSA的植物受体,揭示了MeSA介导的植物气传性免疫的分子机制及其植物病毒的反防御机制,为防治病虫害提供了突破点和研究方向。(Nature | 清华大学刘玉乐团队揭示水杨酸甲酯介导的植物气传性免疫的分子机制及病毒的反防御机制

 

35. Lv Hui., Xie Nuli., Li Mingqiang., Dong Mingkai., Sun Chenyun., Zhang Qian., Zhao Lei., Li Jiang., Zuo Xiaolei., Chen Haibo., Wang Fei., Fan Chunhai.(2023). DNA-based programmable gate arrays for general-purpose DNA computing. Nature, 622(7982), 292-300.(20230913,上海交通大学,樊春海、王飞)

 

发展了一种支持通用性数字计算的DNA可编程门阵列(DNA-based programmable gate array, DPGA),可通过分子指令编程的方式实现通用数字DNA计算,实现了无衰减大规模液相分子电路的构建。(Nature | 樊春海/王飞团队开发支持通用性数字计算的DNA可编程门阵列

 

36. Gao Xiaopan., Shang Kun., Zhu Kaixiang., Wang Linyue., Mu Zhixia., Fu Xingke., Yu Xia., Qin Bo., Zhu Hongtao., Ding Wei., Cui Sheng.(2023). Nucleic-acid-triggered NADase activation of a short prokaryotic Argonaute.Nature.(20231002,中国医学科学院病原生物学研究所,崔胜;中国科学院物理研究所,丁玮、朱洪涛

 

揭示了原核生物短pAgo在外源核酸诱导下发挥功能的分子机理。(Nature|崔胜/丁玮/朱洪涛合作揭示外源核酸诱导的原核生物短Ago(Crt-SPARTA)系统激活的分子机制

 

37. Zhang Feng., Zhang Bo., Wang Yuying., Jiang Runmin., Liu Jin., Wei Yuexian., Gao Xinyue., Zhu Yichao., Wang Xinli., Sun Mao., Kang Junjun., Liu Yingying., You Guoxing., Wei Ding., Xin Jiajia., Bao Junxiang., Wang Meiqing., Gu Yu., Wang Zhe., Ye Jing., Guo Shuangping., Huang Hongyan., Sun Qiang.(2023). An extra-erythrocyte role of haemoglobin body in chondrocyte hypoxia adaption.Nature, 622(7984), 834-841.(20231004,军事科学院军事医学研究院,孙强;空军军医大学,张丰

 

首次报道了软骨细胞在缺氧时产生大量血红蛋白,在细胞质内形成无膜的血红蛋白小体(Hemoglobin Body, Hedy),在缺氧加剧的情况下,释放储存的氧气,以维持软骨细胞的存活和生长板的发育。(Nature | 孙强/张丰团队发现新型亚细胞结构-血红蛋白小体促进软骨细胞的缺氧耐受

 

38. Ma Shuangshuang., Chen Min., Jiang Yihao., Xiang Xinkuan., Wang Shiqi., Wu Zuohang., Li Shuo., Cui Yihui., Wang Junying., Zhu Yanqing., Zhang Yan., Ma Huan., Duan Shumin., Li Haohong., Yang Yan., Lingle Christopher J., Hu Hailan.(2023). Sustained antidepressant effect of ketamine through NMDAR trapping in the LHb. Nature, 622(7984), 802-809.(20231018,浙江大学,胡海岚

 

该研究工作在前期快速抗抑郁作用机制的基础之上,进一步回答了氯胺酮长时程抗抑郁的作用机制。这一研究成果完善了团队先前提出的以外侧缰核为核心的氯胺酮抗抑郁作用脑机制,形成了更为全面完整的理论体系,为优化氯胺酮的临床用药策略,开发新型用药方案提供了理论指导。(Nature | 胡海岚团队揭示氯胺酮长效抗抑郁的神经机制

 

39. Xie Ruopeng., Edwards Kimberly M., Wille Michelle., Wei Xiaoman., Wong Sook-San., Zanin Mark., El-Shesheny Rabeh., Ducatez Mariette., Poon Leo L M., Kayali Ghazi., Webby Richard J., Dhanasekaran Vijaykrishna.(2023). The episodic resurgence of highly pathogenic avian influenza H5 virus. Nature, 622(7984), 810-817.(20231018,香港大学,Vijaykrishna Dhanasekaran)

 

研究使用流行病学、空间和基因组学方法,分析了HPAI H5暴发起源的变化,揭示了病毒生态学和演化的显著变化。结果强调了HPAI H5暴发中心向着亚洲以外的地区转移,野生鸟类中不断增加的HPAI H5感染促进了地理扩张和宿主范围扩张,加速病毒扩散速度,增强重组潜力。

 

40. Xiao Na., Xu Shuang., Li Ze-Kai., Tang Min., Mao Renbo., Yang Tian., Ma Si-Xing., Wang Peng-Hao., Li Meng-Tong., Sunilkumar Ajay., Rouyer François., Cao Li-Hui., Luo Dong-Gen.(2023). A single photoreceptor splits perception and entrainment by cotransmission. Nature, 623(7987), 562-570.(20231025,北京大学,罗冬根

 

报道了在果蝇中局部反差和整体亮度信号的分离可通过同一感光细胞同时释放两种递质来实现。(Nature | 罗冬根团队发现“一细胞,两递质,两视觉功能”的神经机制

 

41. Sun Shuhui., Li Jiaming., Wang Si., Li Jingyi., Ren Jie., Bao Zhaoshi., Sun Le., Ma Xibo., Zheng Fangshuo., Ma Shuai., Sun Liang., Wang Min., Yu Yan., Ma Miyang., Wang Qiaoran., Chen Zhiyuan., Ma He., Wang Xuebao., Wu Zeming., Zhang Hui., Yan Kaowen., Yang Yuanhan., Zhang Yixin., Zhang Sheng., Lei Jinghui., Teng Zhao-Qian., Liu Chang-Mei., Bai Ge., Wang Yan-Jiang., Li Jian., Wang Xiaoqun., Zhao Guoguang., Jiang Tao., Belmonte Juan Carlos Izpisua., Qu Jing., Zhang Weiqi., Liu Guang-Hui.(2023). CHIT1-positive microglia drive motor neuron ageing in the primate spinal cord. Nature, 624(7992), 611-620.(20231031,中国科学院动物研究所,刘光慧、曲静;中国科学院北京基因组研究所,张维绮

 

发现一群全新的在年老的灵长类动物的脊髓中特异存在的CHIT1阳性小胶质细胞亚型,并将其命名为AIMoN-CPM(Aging-Induced Motor Neuron toxic CHIT1-Positive Microglia),这类细胞可以通过旁分泌CHIT1蛋白激活运动神经元中的SMAD信号,进而驱动运动神经元衰老,而补充维生素C可抑制脊髓运动神经元的衰老和退行。(专家点评Nature | 刘光慧/张维绮/曲静破解灵长类脊髓衰老驱动力

 

42. Pidathala Shabareesh., Liao Shuyun., Dai Yaxin., Li Xiao., Long Changkun., Chang Chi-Lun., Zhang Zhe., Lee Chia-Hsueh.(2023). Mechanisms of neurotransmitter transport and drug inhibition in human VMAT2. Nature, 623(7989), 1086-1092.(20231101,美国圣裘德儿童研究医院,李佳学;北京大学,张哲

 

该工作首次报道了人源VMAT2蛋白结合抑制剂TBZ、RSP及其底物5-羟色胺(5-HT)的冷冻电镜结构,揭示了两种抑制剂发挥功能以及VMAT2转运底物的分子机制。(Nature | 李佳学/张哲课题组共同揭示囊泡单胺转运蛋白VMAT2的药物抑制及底物转运机制

 

43. Xu Zheng., Guo Lulu., Yu Jingjing., Shen Siyuan., Wu Chao., Zhang Weifeng., Zhao Chang., Deng Yue., Tian Xiaowen., Feng Yuying., Hou Hanlin., Su Lantian., Wang Hongshuang., Guo Shuo., Wang Heli., Wang Kexin., Chen Peipei., Zhao Jie., Zhang Xiaoyu., Yong Xihao., Cheng Lin., Liu Lunxu., Yang Shengyong., Yang Fan., Wang Xiaohui., Yu Xiao., Xu Yunfei., Sun Jin-Peng., Yan Wei., Shao Zhenhua.(2023). Ligand recognition and G protein coupling of trace amine receptor TAAR1. Nature, 624(7992), 672-681.(20231107,四川大学,邵振华、颜微;山东大学,孙金鹏、于晓、徐云飞

 

发现了TAAR1受体中药物识别口袋的可塑性;基于新机制,筛选获得靶向TAAR1的新配体;结合受体突变实验,阐明了TAAR1激活Gs/Gi信号的不同途径,该研究为靶向TAAR1的药物开发提供了非常重要的理论基础。(专家点评Nature | 邵振华/孙金鹏合作揭示痕量胺受体TAAR1的药理学机制

 

44. Liu Heng., Zheng You., Wang Yue., Wang Yumeng., He Xinheng., Xu Peiyu., Huang Sijie., Yuan Qingning., Zhang Xinyue., Wang Ling., Jiang Kexin., Chen Hong., Li Zhen., Liu Wenbin., Wang Sheng., Xu H Eric., Xu Fei.(2023). Recognition of methamphetamine and other amines by trace amine receptor TAAR1.Nature, 624(7992), 663-671.(20231107,上海科技大学,徐菲;中国科学院上海药物研究所,徐华强;中国科学院分子卓越创新中心,汪胜;上海市刑事科学技术研究院,刘文斌

 

系统性地揭示了METH和其他胺类化合物与TAAR1相互作用的关键结构要素,为治疗药物成瘾和神经精神疾病的新药研发提供了坚实的基础。同时,TAAR1作为单胺类系统的最后一个未解析结构的受体,该研究填补了现有胺能受体结构领域的空白,对于理解单胺类系统的药效学研究具有重要意义,有望推动新一代更有效药物的开发。(Nature | 徐华强/徐菲/汪胜/刘文斌合作揭示“冰毒”与其受体TAAR1的分子识别机制

 

45. Shi Xuyan., Sun Qichao., Hou Yanjie., Zeng Huan., Cao Yong., Dong Mengqiu., Ding Jingjin., Shao Feng.(2023). 624(7991), 442-450.(20231122,北京生命科学研究所,邵峰;中科院生物物理研究所,丁璟珒

 

发现炎症因子IL-18是非经典炎症小体通路caspase-4/5的生理底物,并进一步揭示了天然免疫通路中caspases识别和活化IL-18的精确分子机制。(Nature | 邵峰/丁璟珒合作揭示非经典炎症小体通路识别和活化炎症因子IL-18的分子机制

 

46. Yisimayi Ayijiang., Song Weiliang., Wang Jing., Jian Fanchong., Yu Yuanling., Chen Xiaosu., Xu Yanli., Yang Sijie., Niu Xiao., Xiao Tianhe., Wang Jing., Zhao Lijuan., Sun Haiyan., An Ran., Zhang Na., Wang Yao., Wang Peng., Yu Lingling., Lv Zhe., Gu Qingqing., Shao Fei., Jin Ronghua., Shen Zhongyang., Xie Xiaoliang Sunney., Wang Youchun., Cao Yunlong.(2023). Repeated Omicron exposures override ancestral SARS-CoV-2 immune imprinting. Nature.(20231122,北京大学,曹云龙

 

揭示了在已接种新冠原始株疫苗并产生原始株免疫印记的情况下,二次暴露于奥密克戎(Omicron)变异株(通过感染或者疫苗接种)后,机体可生成高比例的奥密克戎特异性中和抗体,极大程度上改善了单次奥密克戎变异株刺激后,由于原始株免疫印记所引起的主要产生靶向交叉结合原始株、非中和表位抗体的现象。(Nature|曹云龙实验室揭示新冠病毒免疫印记重塑机制

 

47. Zhang Bao., He Peng., Lawrence John E G., Wang Shuaiyu., Tuck Elizabeth., Williams Brian A., Roberts Kenny., Kleshchevnikov Vitalii., Mamanova Lira., Bolt Liam., Polanski Krzysztof., Li Tong., Elmentaite Rasa., Fasouli Eirini S., Prete Martin., He Xiaoling., Yayon Nadav., Fu Yixi., Yang Hao., Liang Chen., Zhang Hui., Blain Raphael., Chedotal Alain., FitzPatrick David R., Firth Helen., Dean Andrew., Bayraktar Omer Ali., Marioni John C., Barker Roger A., Storer Mekayla A., Wold Barbara J., Zhang Hongbo., Teichmann Sarah A.(2023). A human embryonic limb cell atlas resolved in space and time. Nature(20231206,中山大学,张宏波;英国Sanger 研究所,Sarah Teichmann)

 

报道了基于单细胞转录组学和空间转录组学技术建立的首个人类肢体发育单细胞图谱,解析了从肢体发生早期到形态完全形成的细胞演变路径和细胞空间位置决定过程。(Nature丨张宏波/Sarah Teichmann合作建立首个人类肢体发育的单细胞图谱并解析关键调控机制

 

48. Xu Wenhao., Li Gerui., Chen Yuan., Ye Xujun., Song Wei.(2023). A novel antidiuretic hormone governs tumour-induced renal dysfunction. Nature, 624(7991), 425-432.(20231206,武汉大学,宋威、叶旭军

 

鉴定到果蝇中第一例明确的抗利尿素——ITPF,并揭示它由恶性肿瘤和肠道内分泌细胞分泌,直接作用于果蝇马氏管(类似于人的肾小管),破坏其排水功能,导致严重的体液潴留。(Nature | 宋威/叶旭军团队揭示肿瘤-肾脏互作新机制

 

49. Wu Di., Chen Qihao., Yu Zhuoya., Huang Bo., Zhao Jun., Wang Yuhang., Su Jiawei., Zhou Feng., Yan Rui., Li Na., Zhao Yan., Jiang Daohua.(2023). Transport and inhibition mechanisms of human VMAT2. Nature.(20231211,中国科学院物理研究所/北京凝聚态物理国家研究中心,姜道华;中国科学院生物物理研究所,赵岩

 

揭示了VMAT2在运输单胺底物过程中的构象变化及转运机制。为理解VMAT2的底物识别、药物抑制、质子耦合转运过程等分子机制提供了重要的结构基础;为开发靶向VMAT2的构象特异性以及亚型特异性药物提供了重要的结构信息。(Nature | 姜道华/赵岩合作揭示囊泡单胺转运体VMAT2的转运及药物抑制的分子机制

 

50. Ye Tong., Jiao Zhouguang., Li Xin., He Zhanlong., Li Yanyan., Yang Fengmei., Zhao Xin., Wang Youchun., Huang Weijin., Qin Meng., Feng Yingmei., Qiu Yefeng., Yang Wenhui., Hu Lingfei., Hu Yaling., Zhai Yu., Wang Erqiang., Yu Di., Wang Shuang., Yue Hua., Wang Yishu., Wang Hengliang., Zhu Li., Ma Guanghui., Wei Wei.(2023). Inhaled SARS-CoV-2 vaccine for single-dose dry powder aerosol immunization. Nature, 624(7992), 630-638.(20231213,中国科学院过程工程研究所,马光辉、魏炜;军事医学科学院生物工程研究所,朱力、王恒樑

 

该研究报告了一种针对新冠病毒(SARS-CoV-2)的吸入式疫苗。与接种前相比,这种混合物能引发免疫反应增强,在小鼠、仓鼠和非人灵长类中提供有力的抗感染保护,有望成为通过注射接种疫苗的替代选项。

 

51. Huang Di., Zhu Xiaofeng., Ye Shuying., Zhang Jiahui., Liao Jianyou., Zhang Ning., Zeng Xin., Wang Jiawen., Yang Bing., Zhang Yin., Lao Liyan., Chen Jianing., Xin Min., Nie Yan., Saw Phei Er., Su Shicheng., Song Erwei.(2023). Tumour circular RNAs elicit anti-tumour immunity by encoding cryptic peptides.Nature.(20231213,中山大学,宋尔卫、苏士成

 

发现肿瘤特异性环状 RNA (circRNA) circFAM53B 非经典途径翻译而来的抗原肽可以有效诱导特异性抗肿瘤免疫反应。(Nature | 宋尔卫团队揭示肿瘤环状RNA通过编码隐性抗原肽诱导抗肿瘤免疫反应
 
2023年Cell
(研究性论文57篇,署名第一作者单位论文1篇,综述1篇)

 

1. Li Jian., Dong Jiangqing., Wang Weitao., Yu Daqi., Fan Xinyu., Hui Yan Chit., Lee Clare S K., Lam Wai Hei., Alary Nathan., Yang Yang., Zhang Yingyi., Zhao Qian., Chen Chun-Long., Tye Bik-Kwoon., Dang Shangyu., Zhai Yuanliang.(2023). The human pre-replication complex is an open complex. Cell, 186(1), 98-111.e21.(20230105,香港大学,翟元梁;香港科技大学,党尚宇;香港科技大学/康奈尔大学,戴碧瓘;法国居里研究所,陈春龙)

 

成功从HeLa细胞中纯化得到人内源MCM2-7 DH-DNA复合物,并解析出2.59埃高分辨率冷冻电镜结构,揭示了人细胞DNA复制起始新机制。(Cell | 翟元梁/党尚宇/戴碧瓘/陈春龙团队揭示人体细胞DNA复制起始新机制

 

2. Liu Xiaoqian., Liu Zunpeng., Wu Zeming., Ren Jie., Fan Yanling., Sun Liang., Cao Gang., Niu Yuyu., Zhang Baohu., Ji Qianzhao., Jiang Xiaoyu., Wang Cui., Wang Qiaoran., Ji Zhejun., Li Lanzhu., Esteban Concepcion Rodriguez., Yan Kaowen., Li Wei., Cai Yusheng., Wang Si., Zheng Aihua., Zhang Yong E., Tan Shengjun., Cai Yingao., Song Moshi., Lu Falong., Tang Fuchou., Ji Weizhi., Zhou Qi., Belmonte Juan Carlos Izpisua., Zhang Weiqi., Qu Jing., Liu Guang-Hui.(2023). Resurrection of endogenous retroviruses during aging reinforces senescence. Cell, 186(2), 287-304.e26.(20230106,中国科学院动物研究所,刘光慧、曲静;中国科学院北京基因组研究所,张维绮

 

该研究首次发现了年轻的ERV亚家族在细胞衰老过程中被再度唤醒,提出了古病毒复活介导衰老程序化及传染性的理论,并且创新性地发展出阻断ERV古病毒复活及扩散以实现延缓衰老的多维干预策略。(专家点评Cell | 刘光慧/曲静/张维绮揭示人类基因组古病毒复活驱动衰老

 

3. Wang Yue., Zhuang Youwen., DiBerto Jeffrey F., Zhou X Edward., Schmitz Gavin P., Yuan Qingning., Jain Manish K., Liu Weiyi., Melcher Karsten., Jiang Yi., Roth Bryan L., Xu H Eric.(2023). Structures of the entire human opioid receptor family. Cell, 186(2), 413-427.e17.(20230112,中国科学院上海药物研究所,徐华强、庄友文;美国北卡罗莱纳大学教堂山分校,Bryan L. Roth)

 

系统地解析了阿片受体家族四个亚型μOR、δOR、κOR、NOPR和各自的选择性多肽包括内啡肽、内吗啡肽、强啡肽、皮啡肽和痛敏肽的冷冻电镜复合物结构,结合大量细胞水平的功能实验,揭示了多肽类配体和阿片受体的结合模式,阐述了它们的选择性和保守性机制,为“信使-信箱-效能”模式提供了结构和功能支持。(Cell | 徐华强/庄友文/Bryan L. Roth合作阐述阿片受体家族与内啡肽系统的分子作用机制

 

4. Meng Jian-Jun., Shen Jia-Wei., Li Guang., Ouyang Chang-Jie., Hu Jia-Xi., Li Zi-Shuo., Zhao Hang., Shi Yi-Ming., Zhang Mei., Liu Rong., Chen Ju-Tao., Ma Yu-Qian., Zhao Huan., Xue Tian.(2023). Light modulates glucose metabolism by a retina-hypothalamus-brown adipose tissue axis. Cell, 186(2), 398-412.e17.(20230119,中国科学技术大学,薛天

 

发现了光直接通过激活视网膜上特殊的感光细胞,经视神经至下丘脑和延髓的系列神经核团传递信号,最终通过交感神经作用于外周的棕色脂肪组织,直接压抑了机体的血糖代谢能力。(专家点评Cell | 薛天团队揭示光感知调控血糖代谢的神经机制

 

5. Zhu Yongsheng., Yan Peng., Wang Rui., Lai Jianghua., Tang Hua., Xiao Xu., Yu Rongshan., Bao Xiaorui., Zhu Feng., Wang Kena., Lu Ye., Dang Jie., Zhu Chao., Zhang Rui., Dang Wei., Zhang Bao., Fu Quanze., Zhang Qian., Kang Chongao., Chen Yujie., Chen Xiaoyu., Liang Qing., Wang Kejia.(2023). Opioid-induced fragile-like regulatory T cells contribute to withdrawal. Cell, 186(3), 591-606.e23.(20230119,厦门大学,王科嘉

 

该研究揭示了成瘾人群外周免疫微环境变化,建立起脆弱样调节性T细胞与成瘾戒断行为的免疫学联系,有望通过免疫干预的方式治疗阿片类药物成瘾。(Cell | 王科嘉课题组发文揭示阿片类药物成瘾相关的免疫学机制

 

6. Fan Zhengxiao., Chang Jiarui., Liang Yilan., Zhu Hong., Zhang Chaoyi., Zheng Diyang., Wang Junying., Xu Ying., Li Qi-Jing., Hu Hailan.(2023). Neural mechanism underlying depressive-like state associated with social status loss.Cell, 186(3), 560-576.e17.(20230123,浙江大学,胡海岚

 

该研究构建了基于心理应激的社会地位下调导致抑郁的动物模型,阐释了社会竞争挫败和等级地位下降导致抑郁症的神经机制,揭示了控制社会竞争行为与情绪状态环路之间的相互作用,有助于发现由社会竞争压力所导致的心理和生理健康问题的来源,为社会竞争压力导致的抑郁症提供了预防和治疗的新见解。(Cell | 胡海岚团队揭示社会地位下降导致抑郁的神经机制

 

7. Cui Qinqin., Bi Hongyun., Lv Zhanyun., Wu Qigui., Hua Jianfeng., Gu Bokai., Huo Chanjuan., Tang Mingmin., Chen Yanqin., Chen Chongjiu., Chen Sihan., Zhang Xinrui., Wu Zhangrui., Lao Zhengkai., Sheng Nengyin., Shen Chengyong., Zhang Yongdeng., Wu Zhi-Ying., Jin Zhigang., Yang Peiguo., Liu Huaqing., Li Jinsong., Bai Ge.(2023). Diverse CMT2 neuropathies are linked to aberrant G3BP interactions in stress granules. Cell, 186(4), 803-820.e25.(20230203,浙江大学,白戈;中国科学院分子细胞科学卓越创新中心,李劲松

 

该工作揭示了应激颗粒异常是介导不同亚型CMT的共同致病机制,为针对多亚型CMT的广谱治疗药物的开发提供了重要理论基础,也为其他疾病遗传异质性的机制研究提供了新的思路。(专家点评Cell封面文章 | 白戈/李劲松揭示无膜细胞器异常是导致周围神经病的关键机制

 

8. Huiting Erin., Cao Xueli., Ren Jie., Athukoralage Januka S., Luo Zhaorong., Silas Sukrit., An Na., Carion Héloïse., Zhou Yu., Fraser James S., Feng Yue., Bondy-Denomy Joseph.(2023). Bacteriophages inhibit and evade cGAS-like immune function in bacteria. Cell, 186(4), 864-876.e21.(20230206,美国加州大学旧金山分校,Joseph Bondy-Denomy;北京化工大学,冯越

 

本文发现了内源性CBASS系统的抗噬菌体免疫作用,并提出了噬菌体抑制和逃避CBASS系统免疫的有效策略。Acb2蛋白作为广谱抑制蛋白,其可以通过结合多种环状寡核苷酸来抑制多种类型的CBASS系统。(Cell | Joseph Bondy-Denomy/冯越合作揭示噬菌体抑制和逃逸细菌CBASS免疫系统的分子机制

 

9. Qin Ning., Li Lingyun., Ji Xu., Pereira Rui., Chen Yu., Yin Shile., Li Chaokun., Wan Xiaozhen., Qiu Danye., Jiang Junfeng., Luo Hao., Zhang Yueping., Dong Genlai., Zhang Yiming., Shi Shuobo., Jessen Henning J., Xia Jianye., Chen Yun., Larsson Christer., Tan Tianwei., Liu Zihe., Nielsen Jens.(2023). Flux regulation through glycolysis and respiration is balanced by inositol pyrophosphates in yeast. Cell, 186(4), 748-763.e15.(20230208,北京化工大学,Jens Nielsen、刘子鹤

 

该研究解释了焦磷酸肌醇作为能量传感器调控平衡糖酵解和呼吸通量的重要机制,并提供了酵母如何在能量短缺压力下通过调节转录因子影响代谢可塑性的见解。同时,提出焦磷酸肌醇调控酵解和呼吸平衡新机制。(Cell | Jens Nielsen/刘子鹤提出焦磷酸肌醇调控酵解和呼吸平衡新机制

 

10. Gao Yina., Luo Xiu., Li Peipei., Li Zhaolong., Ye Feng., Liu Songqing., Gao Pu.(2023). Molecular basis of RADAR anti-phage supramolecular assemblies. Cell, 186(5), 999-1012.e20.(20230209,中科院生物物理研究所,高璞

 

发现了RADAR不同组分间的互作关系,揭示了其通过形成新型超分子复合体来实现RNA装载、运输和脱氨修饰的精妙偶联机制,拓展了我们对细菌-病毒博弈复杂性的理解,并为开发基于RADAR的多种生物学工具提供了思路。(Cell | 高璞团队揭示新型超分子机器执行RNA脱氨和抗病毒免疫的机制

 

11. Chen Jing., Yang Xinglou., Si Haorui., Gong Qianchun., Que Tengcheng., Li Jing., Li Yang., Wu Chunguang., Zhang Wei., Chen Ying., Luo Yun., Zhu Yan., Li Bei., Luo Dongsheng., Hu Ben., Lin Haofeng., Jiang Rendi., Jiang Tingting., Li Qian., Liu Meiqin., Xie Shizhe., Su Jia., Zheng Xiaoshuang., Li Ang., Yao Yulin., Yang Yong., Chen Panyu., Wu Aiqiong., He Meihong., Lin Xinhua., Tong Yigang., Hu Yanling., Shi Zheng-Li., Zhou Peng.(2023). A bat MERS-like coronavirus circulates in pangolins and utilizes human DPP4 and host proteases for cell entry. Cell, 186(4), 850-863.e16.(20230216,中国科学院武汉病毒研究所/广州实验室、周鹏;中国科学院武汉病毒所,石正丽;广西医科大学,胡艳玲;北京化工大学,童贻刚;复旦大学,林鑫华

 

通过细胞、类器官和动物模型,该研究证实该病毒可以潜在感染人并具备人群传播的风险。作为一个被频繁走私的物种,穿山甲极可能从生态学和病毒学上促进了蝙蝠冠状病毒对人群的跨种感染。(Cell | 周鹏/石正丽/胡艳玲/童贻刚/林鑫华合作发现穿山甲作为蝙蝠病毒跨种的中间及适应性宿主的证据

 

12. Gao Yue., Hong Yujuan., Huang Lihong., Zheng Shuang., Zhang Haibin., Wang Shihua., Yao Yi., Zhao Yini., Zhu Lin., Xu Qiang., Chai Xuhui., Zeng Yuanyuan., Zeng Yuzhe., Zheng Liangkai., Zhou Yulin., Luo Hong., Zhang Xian., Zhang Hongfeng., Zhou Ying., Fu Guo., Sun Hao., Huang Timothy Y., Zheng Qiuyang., Xu Huaxi., Wang Xin.(2023). β2-microglobulin functions as an endogenous NMDAR antagonist to impair synaptic function. Cell, 186(5), 1026-1038.e20.(20230302,厦门大学,王鑫

 

该研究揭示了唐氏综合征中外周免疫参与中枢神经系统损伤的分子机制,发现了B2M拮抗NMDA受体的非经典功能,为认知障碍疾病提供了新的治疗思路和药物靶点。(专家点评Cell | “远水也可救近火!”王鑫团队揭示干预血液中的免疫因子有望治疗认知障碍疾病,理解唐氏认知损伤机制提供全新视角

 

13. Qin Fangfei., Li Boyuan., Wang Hui., Ma Sihui., Li Jiaofeng., Liu Shanglin., Kong Linghao., Zheng Huangtao., Zhu Rongfeng., Han Yu., Yang Mingdong., Li Kai., Ji Xiong., Chen Peng R.(2023). Linking chromatin acylation mark-defined proteome and genome in living cells. Cell, 186(5), 1066-1085.e36.(20230302,北京大学,陈鹏、季雄

 

发展了在活细胞内“关联解析”蛋白质化学修饰机制与功能的“单位点-多组学”技术-SiTomics,揭示了受染色质酰化修饰介导的丰富的相互作用组学信息,建立了表观遗传调控的蛋白质组与基因组“信息关联”。(专家点评Cell突破丨陈鹏团队实现活细胞中染色质化学修饰的编码表达与串联解析

 

14. Shao Changwei., Sun Shuai., Liu Kaiqiang., Wang Jiahao., Li Shuo., Liu Qun., Deagle Bruce E., Seim Inge., Biscontin Alberto., Wang Qian., Liu Xin., Kawaguchi So., Liu Yalin., Jarman Simon., Wang Yue., Wang Hong-Yan., Huang Guodong., Hu Jiang., Feng Bo., De PittàCristiano., Liu Shanshan., Wang Rui., Ma Kailong., Ying Yiping., Sales Gabrielle., Sun Tao., Wang Xinliang., Zhang Yaolei., Zhao Yunxia., Pan Shanshan., Hao Xiancai., Wang Yang., Xu Jiakun., Yue Bowen., Sun Yanxu., Zhang He., Xu Mengyang., Liu Yuyan., Jia Xiaodong., Zhu Jiancheng., Liu Shufang., Ruan Jue., Zhang Guojie., Yang Huanming., Xu Xun., Wang Jun., Zhao Xianyong., Meyer Bettina., Fan Guangyi.(2023). The enormous repetitive Antarctic krill genome reveals environmental adaptations and population insights.Cell, 186(6), 1279-1294.e19.(20230302,青岛华大基因研究院,范广益;University of Oldenburg,Bettina Meyer;中国水产科学研究院黄海水产研究所,邵长伟

 

完成了迄今为止基因组最大的动物——南极磷虾的基因组图谱构建,并揭示了南极磷虾极端环境适应性的分子机制和群体演化历程。

 

15. Zhao Yan., Shi Hui., Pan Ying., Lyu Mohan., Yang Zhixuan., Kou Xiaoxia., Deng Xing Wang., Zhong Shangwei.(2023). Sensory circuitry controls cytosolic calcium-mediated phytochrome B phototransduction. Cell, 186(6), 1230-1243.e14.(20230316,北京大学,钟上威

 

报道植物通过“光-钙调控环路”,快速激活两个钙依赖性蛋白激酶,在Ser80和Ser106位点磷酸化phyB,控制phyB入核。该工作同时提出了胞质第二信号钙离子在受体层面解码为特定转导通路的新机制。(Cell | 改变对光信号通路认知,钟上威团队揭示植物光温受体phyB的入核调控机制

 

16. Li Huan-Yu., Zhu Min-Zhen., Yuan Xin-Rui., Guo Zhi-Xin., Pan Yi-Da., Li Yuan-Qing., Zhu Xin-Hong.(2023). A thalamic-primary auditory cortex circuit mediates resilience to stress. Cell, 186(7), 1352-1368.e18.(20230330,南方医科大学,朱心红

 

表明丘脑-初级听觉皮层环路介导心理弹性,为未来神经调控治疗抑郁症提供了新的策略与靶点。(Cell | 朱心红团队揭示丘脑-初级听觉皮层环路介导心理弹性

 

17. Li Ningning., Chen Siyi., Xu Kui., He Meng-Ting., Dong Meng-Qiu., Zhang Qiangfeng Cliff., Gao Ning.(2023). Structural basis of membrane skeleton organization in red blood cells. Cell, 186(9), 1912-1929.e18.(20230411,北京大学,高宁

 

该工作解析了红细胞膜骨架的核心复合物spectrin-actin junctional complex的高分辨结构,为理解膜骨架的组装和动态性以及其组成元件在膜骨架稳定和调控中的分子机制提供了一个结构框架。(Cell | 高宁团队揭示血红细胞Spectrin-Actin膜骨架系统的组织规则及结构稳定性的分子基础

 

18. Wang Yanyan., Zhang Senxin., Yang Xinrui., Hwang Joyce K., Zhan Chuanzong., Lian Chaoyang., Wang Chong., Gui Tuantuan., Wang Binbin., Xie Xia., Dai Pengfei., Zhang Lu., Tian Ying., Zhang Huizhi., Han Chong., Cai Yanni., Hao Qian., Ye Xiaofei., Liu Xiaojing., Liu Jiaquan., Cao Zhiwei., Huang Shaohui., Song Jie., Pan-Hammarström Qiang., Zhao Yaofeng., Alt Frederick W., Zheng Xiaoqi., Da Lin-Tai., Yeap Leng-Siew., Meng Fei-Long.(2023). Mesoscale DNA feature in antibody-coding sequence facilitates somatic hypermutation. Cell, 186(10), 2193-2207.e19.(20230424,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心,孟飞龙;上海交通大学,叶菱秀

 

该工作从经典的生化方法出发,联合高通量测序技术、分子动力学模拟和单分子生化方法等多种研究手段,在生化、细胞和小鼠模型三个层面全面揭示了一种在多数物种中普遍存在的通过DNA柔性调控抗体基因超突变的分子机制。为DNA力学性质调控细胞生命活动提供了有力的实证,揭示了编码密码子的非编码功能。(专家点评Cell | 孟飞龙/叶菱秀合作揭开抗体基因超突变的DNA柔性基础

 

19. Zhai Jinglei., Xu Yanhong., Wan Haifeng., Yan Rui., Guo Jing., Skory Robin., Yan Long., Wu Xulun., Sun Fengyuan., Chen Gang., Zhao Wentao., Yu Kunyuan., Li Wei., Guo Fan., Plachta Nicolas., Wang Hongmei.(2023). Neurulation of the cynomolgus monkey embryo achieved from 3D blastocyst culture. Cell, 186(10), 2078-2091.e18.(20230511,中国科学院动物研究所,王红梅、郭帆、李伟;美国宾夕法尼亚大学,Nicolas Plachta)

 

建立了一个可支持食蟹猴胚胎体外发育至受精后25天的3D长时程培养体系,并基于该体系探究了灵长类胚胎中晚期原肠运动和早期神经发育过程中的核心事件和谱系特征。(Cell 背靠背封面丨王红梅课题组及合作团队利用食蟹猴胚胎体外培养模型揭示灵长类早期神经胚发育特征

 

20. Cao Duanfang., Ma Bingting., Cao Ziyi., Zhang Xinzheng., Xiang Ye.(2023). Structure of Semliki Forest virus in complex with its receptor VLDLR. Cell, 186(10), 2208-2218.e15.(20230424,清华大学,向烨;中国科学院生物物理所,章新政

 

阐述了不同宿主中进化上相对保守的通用细胞受体通过其多个相似结构域弱相互作用的协同工作与病毒特异性结合,从而介导病毒跨物种传播。(Cell | 向烨/章新政合作解析虫媒病毒跨物种传播分子机制

 

21. Gong Yandong., Bai Bing., Sun Nianqin., Ci Baiquan., Shao Honglian., Zhang Ting., Yao Hui., Zhang Youyue., Niu Yuyu., Liu Lizhong., Zhao Hu., Wu Hao., Zhang Lei., Wang Tianxiang., Li Shangang., Wei Yulei., Yu Yang., Ribeiro Orsi Ana Elisa., Liu Bing., Ji Weizhi., Wu Jun., Chen Yongchang., Tan Tao.(2023). Ex utero monkey embryogenesis from blastocyst to early organogenesis. Cell, 186(10), 2092-2110.e23.(20230511,昆明理工大学,谭韬、陈永昌、季维智;中国人民解放军总医院,刘兵;德州西南医学中心,吴军)

 

开发了一种能够支持食蟹猴胚胎体外发育至早期器官发生的3D培养体系,并系统研究了非人灵长类从原肠胚形成到早期器官发生过程的重要细胞组成及谱系分化轨迹,研究结果将有助于了解人类胚胎发育畸形及孕早期流产的病因。(Cell背靠背封面 | 谭韬/陈永昌/吴军/季维智/刘兵合作开发食蟹猴胚胎体外发育3D模型揭示早期组织器官的发生

 

22. Wu Yaoyao., Li Dawei., Hu Yong., Li Hongbo., Ramstein Guillaume P., Zhou Shaoqun., Zhang Xinyan., Bao Zhigui., Zhang Yu., Song Baoxing., Zhou Yao., Zhou Yongfeng., Gagnon Edeline., Särkinen Tiina., Knapp Sandra., Zhang Chunzhi., Städler Thomas., Buckler Edward S., Huang Sanwen.(2023). Phylogenomic discovery of deleterious mutations facilitates hybrid potato breeding. Cell, 186(11), 2313-2328.e15.(20230504,中国农业科学院深圳农业基因组研究所,黄三文

 

本研究开创了进化透镜鉴定有害突变的新技术,提出了高度纯合自交系起始材料反直觉选择的新依据,开发了全基因组预测农艺性状的新策略,标志着我国在马铃薯育种理论和技术上站在了世界领先地位。(专家点评 Cell | 黄三文团队开发“进化透镜”,加速杂交马铃薯育种

 

23. Zhao Zhifeng., Zhou Yiliang., Liu Bo., He Jing., Zhao Jiayin., Cai Yeyi., Fan Jingtao., Li Xinyang., Wang Zilin., Lu Zhi., Wu Jiamin., Qi Hai., Dai Qionghai.(2023). Two-photon synthetic aperture microscopy for minimally invasive fast 3D imaging of native subcellular behaviors in deep tissue. Cell, 186(11), 2475-2491.e22.(20230512,清华大学,戴琼海、吴嘉敏、祁海

 

首次提出了基于空间约束的多角度衍射编码,实现非相干光孔径合成;建立了双光子合成孔径显微术(Two-photon synthetic aperture microscopy, 2pSAM),“化点为针”,通过多角度针状光束的扫描在实现高速三维感知的同时,将双光子成像光毒性降低了1000倍以上。(Cell | 将双光子成像光毒性降低1000倍以上——戴琼海等提出衍射编码双光子合成孔径显微术,实现深层活体组织时空跨尺度观测

 

24. Wang Wei., Qin Li., Zhang Wenjing., Tang Linghui., Zhang Chao., Dong Xiaojing., Miao Pei., Shen Meng., Du Huilong., Cheng Hangyuan., Wang Ke., Zhang Xiangyun., Su Min., Lu Hongwei., Li Chang., Gao Qiang., Zhang Xiaojuan., Huang Yun., Liang Chengzhi., Zhou Jian-Min., Chen Yu-Hang.(2023). WeiTsing, a pericycle-expressed ion channel, safeguards the stele to confer clubroot resistance. Cell, 186(12), 2656-2671.e18.(20230608,中国科学院遗传与发育生物学研究所,陈宇航、周俭民

 

成功克隆了广谱高抗根肿病基因WeiTsing (WTS, 卫青),解析了WTS五聚体的三维结构并揭示了其阳离子通道功能,阐明了WTS介导钙信号激活植物免疫应答的分子机制。(Cell | 周俭民/陈宇航合作解析广谱抗根肿病基因“卫青”的分子机制

 

25. Zhou Lunni., Liu Haobin., Liu Siyu., Yang Xiaoyu., Dong Yue., Pan Yun., Xiao Zhuang., Zheng Beihong., Sun Yan., Huang Pengyu., Zhang Xixi., Hu Jin., Sun Rui., Feng Shan., Zhu Yi., Liu Mingxi., Gui Miao., Wu Jianping.(2023). Structures of sperm flagellar doublet microtubules expand the genetic spectrum of male infertility. Cell, 186(13), 2897-2910.e19.(20230608,西湖大学生,吴建平;浙江大学,桂淼;南京医科大学、刘明兮

 

报道了小鼠和人的精子鞭毛微管二联体复合物的冷冻电镜结构,并鉴定了多个精子特异的微管结合蛋白。结合临床数据他们发现在10个微管结合蛋白上的突变与男性弱精症有关联,并由此定义了一类新型的弱精症亚型。该工作为理解精子运动的结构基础以及相关男性不育症的诊断和治疗提供了重要线索。(Cell|吴建平/桂淼/刘明兮合作报道精子鞭毛微管结构并定义新型弱精症亚型

 

26. Deng Pujuan., Tan Shun-Qing., Yang Qi-Yu., Fu Liangzheng., Wu Yachao., Zhu Han-Zhou., Sun Lei., Bao Zhangbin., Lin Yi., Zhang Qiangfeng Cliff., Wang Haoyi., Wang Jia., Liu Jun-Jie Gogo.(2023). Structural RNA components supervise the sequential DNA cleavage in R2 retrotransposon. Cell, 186(13), 2865-2879.e20.(20230609,清华大学,刘俊杰、王家

 

报道了R2逆转座子的mRNA中存在两段结构性的RNA,共同调控顺序性的DNA双链切割,从而保证逆转座的准确进行。(专家点评Cell | 自私的基因!刘俊杰课题组揭示逆转座子在基因组上跳跃的分子机制

 

27. Chen Haiwei., Rosen Connor E., González-Hernández Jaime A., Song Deguang., Potempa Jan., Ring Aaron M., Palm Noah W.(2023). Highly multiplexed bioactivity screening reveals human and microbiota metabolome-GPCRome interactions. Cell, 186(14), 3095-3110.e19.(20230614,复旦大学,陈海威;耶鲁大学,Noah Palm)

 

结合条形码技术和下一代基因测序技术,将PRESTO-Tango技术升级为PRESTO-Salsa筛选平台(Parallel Receptor-ome Expression and Screening via Transcriptional Output-Salsa),在(96孔板)单孔中集成314个GPCR报告细胞系,用于“一对多”功能筛选。(Cell | 陈海威等开发PRESTO-Salsa筛选平台,初步绘制人体/人体细菌代谢物-GPCR作用图谱

 

28. He Kaixin., Wan Tingting., Wang Decai., Hu Ji., Zhou Tingyue., Tao Wanyin., Wei Zheng., Lu Qiao., Zhou Rongbin., Tian Zhigang., Flavell Richard A., Zhu Shu.(2023). Gasdermin D licenses MHCII induction to maintain food tolerance in small intestine. Cell, 186(14), 3033-3048.e20.(20230615,中国科学技术大学,朱书

 

发现了十二指肠中GSDMD可以被食物抗原诱导剪切N端产生p13片段,并入核调控肠道上皮细胞(IECs)的二类分子水平,诱导调节性的Tr1细胞介导食物耐受。(Cell | 朱书团队揭示食物抗原诱导免疫耐受的机制

 

29. Peng Changjun., Wu Dong-Dong., Ren Jin-Long., Peng Zhong-Liang., Ma Zhifei., Wu Wei., Lv Yunyun., Wang Zeng., Deng Cao., Jiang Ke., Parkinson Christopher L., Qi Yin., Zhang Zhi-Yi., Li Jia-Tang.(2023). Large-scale snake genome analyses provide insights into vertebrate development. Cell, 186(14), 2959-2976.e22.(20230619,中国科学院成都生物研究所,李家堂

 

基于大规模多组学技术与基因编辑等研究手段,全面揭示了蛇类起源及特殊表型演化的遗传机制。(专家点评Cell | 李家堂团队揭示蛇类的起源与演化机制

 

30. Li Hui., Wang Jinlong., Kuan Tung Ariel., Tang Bozeng., Feng Li., Wang Jiuyu., Cheng Zhi., Skłenar Jan., Derbyshire Paul., Hulin Michelle., Li Yufei., Zhai Yi., Hou Yingnan., Menke Frank L H., Wang Yanli., Ma Wenbo.(2023). Pathogen protein modularity enables elaborate mimicry of a host phosphatase.Cell, 186(15), 3196-3207.e17.(20230626,中国科学院生物物理研究所,王艳丽;英国塞恩斯伯里实验室,马文勃)

 

该研究综合运用遗传学、生物化学、结构生物学、蛋白质组学等手段,揭示了疫霉产生的效应蛋白通过劫持寄主的Protein Phosphatase 2A (PP2A) 的核心酶,进而促进疫霉侵染的的新机制;并首次阐释了效应蛋白可以通过模块化结构的重排组装促进疫霉菌效应子库的功能多样性。(Cell | “道高一尺,魔高一丈”!马文勃/王艳丽团队合作解析疫霉效应蛋白的全新致病机理

 

31. Zhuang Yanrong., Li Zhiyuan., Xiong Shiyue., Sun Chujie., Li Boya., Wu Shuangcheng Alivia., Lyu Jiali., Shi Xiang., Yang Liang., Chen Yutong., Bao Zhangbin., Li Xi., Sun Chuhanwen., Chen Yuling., Deng Haiteng., Li Tingting., Wu Qingfeng., Qi Ling., Huang Yue., Yang Xuerui., Lin Yi.(2023). Circadian clocks are modulated by compartmentalized oscillating translation. Cell, 186(15), 3245-3260.e23.(20230626,清华大学,吝易、杨雪瑞

 

ATXN2和ATXN2L在细胞内发生相分离,且其相分离随昼夜节律振荡。ATXN2和ATXN2L是RNA结合蛋白,故其相分离形成的液滴随节律振荡并依序招募和富集一系列RNA相关的生物过程,并在振荡高峰期募集核糖体和特异RNA,促进关键节律蛋白的翻译。这个在翻译上的加速环节在整个TTFL中起到了稳定和精确调控节律周期的作用。(专家点评Cell | 吝易/杨雪瑞团队揭示相分离调控节律性蛋白翻译的分子机制

 

32. Huang Jiaying., Lin Qiupeng., Fei Hongyuan., He Zixin., Xu Hu., Li Yunjia., Qu Kunli., Han Peng., Gao Qiang., Li Boshu., Liu Guanwen., Zhang Lixiao., Hu Jiacheng., Zhang Rui., Zuo Erwei., Luo Yonglun., Ran Yidong., Qiu Jin-Long., Zhao Kevin Tianmeng., Gao Caixia.(2023). Discovery of deaminase functions by structure-based protein clustering. Cell, 186(15), 3182-3195.e14.(20230627,中国科学院遗传与发育生物学研究所,高彩霞

 

运用AI辅助的大规模蛋白结构预测,建立起全新的基于三级结构的高通量蛋白聚类方法,实现了脱氨酶功能结构的深入挖掘,鉴定到完全区别于已知脱氨工具酶的全新底盘元件,并成功开发了一系列具有我国自主知识产权的新型碱基编辑工具。(Cell | 高彩霞研究组通过创新蛋白聚类方法开发新型碱基编辑工具

 

33. Zhao Zhicong., Qing Ying., Dong Lei., Han Li., Wu Dong., Li Yangchan., Li Wei., Xue Jianhuang., Zhou Keren., Sun Miao., Tan Brandon., Chen Zhenhua., Shen Chao., Gao Lei., Small Andrew., Wang Kitty., Leung Keith., Zhang Zheng., Qin Xi., Deng Xiaolan., Xia Qiang., Su Rui., Chen Jianjun.(2023). QKI shuttles internal mG-modified transcripts into stress granules and modulates mRNA metabolism. Cell, 186(15), 3208-3226.e27.(20230627,美国希望之城国家医疗中心,陈建军、苏瑞;上海交通大学医学院附属仁济医院,夏强

 

筛选并鉴定出mRNA内部m7G修饰的首个识别蛋白QKI (Quaking),而且报道了在应激状态下QKI对细胞应激颗粒内具有m7G修饰mRNA的动态调控作用。(Cell | 陈建军/苏瑞/夏强团队报道首个mRNA内部m7G甲基化修饰识别蛋白

 

34. Xiang Jie., Tao Youqi., Xia Yiyuan., Luo Shilin., Zhao Qinyue., Li Bowei., Zhang Xiaoqian., Sun Yunpeng., Xia Wencheng., Zhang Mingming., Kang Seong Su., Ahn Eun-Hee., Liu Xia., Xie Fang., Guan Yihui., Yang Jenny J., Bu Lihong., Wu Shengxi., Wang Xiaochuan., Cao Xuebing., Liu Cong., Zhang Zhentao., Li Dan., Ye Keqiang.(2023). Development of an α-synuclein positron emission tomography tracer for imaging synucleinopathies. Cell, 186(16), 3350-3367.e19.(20230707,深圳理工大学/中国科学院深圳先进技术研究院,叶克强;上海交通大学,李丹;武汉大学,张振涛

 

首次发现一种很有前景的新型PET示踪剂“[18F]-F0502B”,可在突触核蛋白病中显像聚集神经细胞突触核蛋白α-Syn,该研究成果填补了传统手段诊断帕金森病的空白,使得帕金森病的早期精确诊断成为可能。(Cell | 叶克强/李丹/张振涛合作团队开发新型示踪剂可特异识别帕金森病重要致病蛋白

 

35. Chen Ao., Sun Yidi., Lei Ying., Li Chao., Liao Sha., Meng Juan., Bai Yiqin., Liu Zhen., Liang Zhifeng., Zhu Zhiyong., Yuan Nini., Yang Hao., Wu Zihan., Lin Feng., Wang Kexin., Li Mei., Zhang Shuzhen., Yang Meisong., Fei Tianyi., Zhuang Zhenkun., Huang Yiming., Zhang Yong., Xu Yuanfang., Cui Luman., Zhang Ruiyi., Han Lei., Sun Xing., Chen Bichao., Li Wenjiao., Huangfu Baoqian., Ma Kailong., Ma Jianyun., Li Zhao., Lin Yikun., Wang He., Zhong Yanqing., Zhang Huifang., Yu Qian., Wang Yaqian., Liu Xing., Peng Jian., Liu Chuanyu., Chen Wei., Pan Wentao., An Yingjie., Xia Shihui., Lu Yanbing., Wang Mingli., Song Xinxiang., Liu Shuai., Wang Zhifeng., Gong Chun., Huang Xin., Yuan Yue., Zhao Yun., Chai Qinwen., Tan Xing., Liu Jianfeng., Zheng Mingyuan., Li Shengkang., Huang Yaling., Hong Yan., Huang Zirui., Li Min., Jin Mengmeng., Li Yan., Zhang Hui., Sun Suhong., Gao Li., Bai Yinqi., Cheng Mengnan., Hu Guohai., Liu Shiping., Wang Bo., Xiang Bin., Li Shuting., Li Huanhuan., Chen Mengni., Wang Shiwen., Li Minglong., Liu Weibin., Liu Xin., Zhao Qian., Lisby Michael., Wang Jing., Fang Jiao., Lin Yun., Xie Qing., Liu Zhen., He Jie., Xu Huatai., Huang Wei., Mulder Jan., Yang Huanming., Sun Yangang., Uhlen Mathias., Poo Muming., Wang Jian., Yao Jianhua., Wei Wu., Li Yuxiang., Shen Zhiming., Liu Longqi., Liu Zhiyong., Xu Xun., Li Chengyu.(2023). Single-cell spatial transcriptome reveals cell-type organization in the macaque cortex. Cell, 186(17), 3726-3743.e24.(20230712,中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心,李澄宇、刘志勇、孙怡迪、沈志明;华大生命科学研究院,徐讯、刘龙奇、黎宇翔;临港实验室研究员,魏武;腾讯AI Lab,姚建华

 

该研究利用我国自主研发的超高精度大视场空间转录组测序技术Stereo-seq和高通量单细胞核转录组测序技术DNBelab C4 snRNA-seq,成功绘制了猕猴大脑皮层的细胞类型分类树,并揭示了细胞类型组成和灵长类脑区层级结构之间的关系,为进一步研究各类神经元之间的连接提供了分子细胞基础。(专家点评Cell | 猕猴大脑皮层单细胞空间分布图谱

 

36. Wang Chaolong., Wang Jian., Lu Jiayu., Xiong Yehui., Zhao Zhigang., Yu Xiaowen., Zheng Xiaoming., Li Jing., Lin Qibing., Ren Yulong., Hu Yang., He Xiaodong., Li Chao., Zeng Yonglun., Miao Rong., Guo Mali., Zhang Bosen., Zhu Ying., Zhang Yunhui., Tang Weijie., Wang Yunlong., Hao Benyuan., Wang Qiming., Cheng Siqi., He Xiaojuan., Yao Bowen., Gao Junwen., Zhu Xufei., Yu Hao., Wang Yong., Sun Yan., Zhou Chunlei., Dong Hui., Ma Xiaoding., Guo Xiuping., Liu Xi., Tian Yunlu., Liu Shijia., Wang Chunming., Cheng Zhijun., Jiang Ling., Zhou Jiawu., Guo Huishan., Jiang Liwen., Tao Dayun., Chai Jijie., Zhang Wei., Wang Haiyang., Wu Chuanyin., Wan Jianmin.(2023). A natural gene drive system confers reproductive isolation in rice. Cell, 186(17), 3577-3592.e18.(20230726,南京农业大学,万建民;中国农业科学院作物科学研究所,吴传银、王海洋

 

系统鉴定了引起籼稻和粳稻杂种花粉不育的位点,并对其中一个最主效的位点进行了基因克隆和遗传、分子机制的深入解析,解开了水稻生殖隔离之谜,同时揭示了基因的演化规律以及其在不同水稻种质资源之间的分布。(Cell | 万建民院士团队阐明籼稻粳稻杂种不育分子机理,破解水稻生殖隔离之谜

 

37. Meng Jiang-Guo., Xu Yin-Jiao., Wang Wei-Qi., Yang Fei., Chen Shu-Yan., Jia Peng-Fei., Yang Wei-Cai., Li Hong-Ju.(2023). Central-cell-produced attractants control fertilization recovery. Cell, 186(17), 3593-3605.e12.(20230728,中国科学院遗传与发育生物学研究所,李红菊

 

回答了植物双受精失败后,胚珠为何仍会持续吸引花粉管的科学问题,为了解自然界某些物种在进化中丢失助细胞的原因提供了线索。更重要的是,该发现为人工授粉挽救濒危植物提供了理论支持,对于人工授粉挽救濒危植物的实践具有指导意义。(Cell | 中科院遗传发育所李红菊研究组发现植物受精恢复新机制

 

38. Hu Ruoyang., Li Xuedong., Hu Yong., Zhang Runjie., Lv Qiang., Zhang Min., Sheng Xianyong., Zhao Feng., Chen Zhijia., Ding Yuhan., Yuan Huan., Wu Xiaofeng., Xing Shuang., Yan Xiaoyu., Bao Fang., Wan Ping., Xiao Lihong., Wang Xiaoqin., Xiao Wei., Decker Eva L., van Gessel Nico., Renault Hugues., Wiedemann Gertrud., Horst Nelly A., Haas Fabian B., Wilhelmsson Per K I., Ullrich Kristian K., Neumann Eva., Lv Bin., Liang Chengzhi., Du Huilong., Lu Hongwei., Gao Qiang., Cheng Zhukuan., You Hanli., Xin Peiyong., Chu Jinfang., Huang Chien-Hsun., Liu Yang., Dong Shanshan., Zhang Liangsheng., Chen Fei., Deng Lei., Duan Fuzhou., Zhao Wenji., Li Kai., Li Zhongfeng., Li Xingru., Cui Hengjian., Zhang Yong E., Ma Chuan., Zhu Ruiliang., Jia Yu., Wang Meizhi., Hasebe Mitsuyasu., Fu Jinzhong., Goffinet Bernard., Ma Hong., Rensing Stefan A., Reski Ralf., He Yikun.(2023). Adaptive evolution of the enigmatic Takakia now facing climate change in Tibet. Cell, 186(17), 3558-3576.e17.(20230809,首都师范大学,何奕騉;德国弗莱堡大学,Ralf Reski)

 

揭示了有植物活化石之称的藻苔在青藏高原的生存法则。

 

39. Tang Fei., Li Jinhu., Qi Lu., Liu Dongfang., Bo Yufei., Qin Shishang., Miao Yuhui., Yu Kezhuo., Hou Wenhong., Li Jianan., Peng Jirun., Tian Zhigang., Zhu Linnan., Peng Hui., Wang Dongfang., Zhang Zemin.(2023). A pan-cancer single-cell panorama of human natural killer cells. Cell, 186(19), 4235-4251.e20.(20230821,北京大学,张泽民;中国科学技术大学,彭慧

 

系统刻画了自然杀伤(NK)细胞在不同癌症类型和组织之间的异质性,发现了肿瘤微环境(TME)特异富集、杀伤功能异常的NK细胞亚类,揭示了NK细胞与微环境中其他组分的潜在调控关系。(Cell | 张泽民/王东方/彭慧/朱琳楠绘制自然杀伤细胞在不同癌症类型和组织之间的异质性图谱

 

40. Sun Honglei., Li Han., Tong Qi., Han Qiqi., Liu Jiyu., Yu Haili., Song Hao., Qi Jianxun., Li Jiaqi., Yang Jizhe., Lan Riguo., Deng Guojing., Chang Haoyu., Qu Yajin., Pu Juan., Sun Yipeng., Lan Yu., Wang Dayan., Shi Yi., Liu William J., Chang Kin-Chow., Gao George F., Liu Jinhua.(2023). Airborne transmission of human-isolated avian H3N8 influenza virus between ferrets.Cell, 186(19), 4074-4084.e11.(20230904,中国农业大学,刘金华;中国科学院微生物研究所,高福

 

证明了H3N8病毒能够在器官型正常人支气管上皮细胞(NHBE)和肺上皮细胞(Calu-3)中有效地感染和复制。

 

41. Yang Min., Ong Jennie., Meng Fanju., Zhang Feixiang., Shen Hui., Kitt Kerstin., Liu Tengfei., Tao Wei., Du Peng.(2023). Spatiotemporal insight into early pregnancy governed by immune-featured stromal cells. Cell, 186(20), 4271-4288.e24.(20230911,北京大学,杜鹏

 

作者结合使用单细胞转录组和华大单细胞空间转录组技术首次对小鼠妊娠早期(E5.5-E9.5)着床位点的细胞组成进行了详细定义,并根据不同细胞的空间动态分布,鉴定出妊娠早期着床位点的8个不同功能中心,最终通过比较健康小鼠和复发性流产模型小鼠着床位点功能中心的差异,进而揭示了胚胎着床初期蜕膜微环境建立及稳态维持是成功妊娠至关重要的条件。(专家点评Cell | 杜鹏团队报道时空解析免疫特性的蜕膜基质细胞介导妊娠早期子宫微环境的建立和稳态维持

 

42. Wang Zeshuai., Wu Zhisheng., Wang Hao., Feng Ruoqing., Wang Guanlin., Li Muxi., Wang Shuang-Yin., Chen Xiaoyan., Su Yiyi., Wang Jun., Zhang Weiwen., Bao Yuzhou., Lan Zhenwei., Song Zhuo., Wang Yiheng., Luo Xianyang., Zhao Lingyu., Hou Anli., Tian Shuye., Gao Hongliang., Miao Wenbin., Liu Yingyu., Wang Huilin., Yin Cui., Ji Zhi-Liang., Feng Mingqian., Liu Hongkun., Diao Lianghui., Amit Ido., Chen Yun., Zeng Yong., Ginhoux Florent., Wu Xueqing., Zhu Yuanfang., Li Hanjie.(2023). An immune cell atlas reveals the dynamics of human macrophage specification during prenatal development. Cell, 186(20), 4454-4471.e19.(20230912,中国科学院深圳先进技术研究院,李汉杰;深圳市宝安区妇幼保健院,朱元方;深圳大学总医院,吴雪清;上海交通大学,Florent Ginhoux;复旦大学;王冠琳

 

该研究通过构建人类产前免疫细胞发育的时空动态图谱,揭示了多种巨噬细胞亚型在发育过程中的分化起源、空间定位、功能特征及转录调控机制。(专家点评Cell | 李汉杰团队等构建人类免疫发育图谱并揭示血管旁巨噬和中枢外类小胶质细胞的分化与功能

 

43. Chen Yan-Mei., Hu Shu-Jian., Lin Xian-Dan., Tian Jun-Hua., Lv Jia-Xin., Wang Miao-Ruo., Luo Xiu-Qi., Pei Yuan-Yuan., Hu Rui-Xue., Song Zhi-Gang., Holmes Edward C., Zhang Yong-Zhen.(2023). Host traits shape virome composition and virus transmission in wild small mammals. Cell, 186(21), 4662-4675.e12.(20230920,复旦大学,张永振

 

对人类传染病重要的动物传染源:啮齿类、蝙蝠和鼩鼱等小型哺乳动物进行了全面、系统的病毒的多样性、进化生态学,以及播散规律研究,并从地理生境、类群、种群、个体、组织器官五个维度系统地揭示了宿主特征等生态因子如何影响病毒组组成和跨物种病毒传播。(Cell | 张永振团队揭示宿主特征决定野生小型哺乳动物中病毒组成和跨种间传播

 

44. Chen Jiayue., Yu Renbo., Li Na., Deng Zhaoguo., Zhang Xinxin., Zhao Yaran., Qu Chengfu., Yuan Yanfang., Pan Zhexian., Zhou Yangyang., Li Kunlun., Wang Jiajun., Chen Zhiren., Wang Xiaoyi., Wang Xiaolian., He Shu-Nan., Dong Juan., Deng Xing Wang., Chen Haodong.(2023). Amyloplast sedimentation repolarizes LAZYs to achieve gravity sensing in plants. Cell, 186(22), 4788-4802.e15.(20230922,清华大学,陈浩东

 

解析了 “淀粉-平衡石”假说的分子机制,其核心是植物偏离重力方向后,淀粉体可通过其表面的TOC蛋白携带LAZY蛋白一起沉降,并引导LAZY蛋白沿着重力方向在细胞膜上形成新的极性分布,进而调控植物的向重力性生长。(Cell | 清华大学陈浩东课题组与合作者揭示植物感受重力的分子机制

 

45. Yu Shanhe., Lin Yingni., Li Yong., Chen Shijun., Zhou Lina., Song Hejie., Yang Cuiping., Zhang Haiqing., Zhou Jianping., Sun Shunchang., Li Yanan., Chen Juan., Feng Ruixue., Qiao Niu., Xie Yinyin., Zhang Ruihong., Yin Tong., Chen Saijuan., Li Qingyun., Zhu Jiang., Qu Jieming.(2023). Systemic immune profiling of Omicron-infected subjects inoculated with different doses of inactivated virus vaccine. Cell, 186(21), 4615-4631.e16.(20230927,上海交通大学瑞金医院,瞿介明、诸江、李庆云、陈赛娟

 

首次系统性地描述了新冠病毒灭活疫苗接种对奥密克戎感染者免疫反应的影响,揭示了3次增强剂灭活疫苗通过诱导 “训练天然免疫”促进单核细胞的活化和成熟,从而发挥强有力抗病毒作用的分子机制。(Cell | 瞿介明/诸江/李庆云/陈赛娟合作系统性地描述新冠病毒灭活疫苗接种对奥密克戎感染者免疫反应的影响

 

46. Lan Zijun., Song Zihan., Wang Zhijuan., Li Ling., Liu Yiqun., Zhi Shuaihua., Wang Ruihan., Wang Jizong., Li Qiyun., Bleckmann Andrea., Zhang Li., Dresselhaus Thomas., Dong Juan., Gu Hongya., Zhong Sheng., Qu Li-Jia.(2023). Antagonistic RALF peptides control an intergeneric hybridization barrier on Brassicaceae stigmas. Cell, 186(22), 4773-4787.e12.(20231007,北京大学,瞿礼嘉,钟声

 

不仅揭示了植物在柱头处关键生殖杂交屏障建立的分子基础,还清楚地解析了上世纪提出的“花粉蒙导效应”,从而找到了一种简单、有效的方法打破植物柱头处的关键生殖障碍。这对于未来我们打破植物种间/属间生殖隔离、实现植物远缘杂交、为农业、园艺等领域创制全新的种质资源具有重要的理论意义和广阔的应用前景。

 

47. Chen Yefei., Hong Zexuan., Wang Jingyi., Liu Kunlin., Liu Jing., Lin Jianbang., Feng Shijing., Zhang Tianhui., Shan Liang., Liu Taian., Guo Pinyue., Lin Yunping., Li Tian., Chen Qian., Jiang Xiaodan., Li Anan., Li Xiang., Li Yuantao., Wilde Jonathan J., Bao Jin., Dai Ji., Lu Zhonghua.(2023). Circuit-specific gene therapy reverses core symptoms in a primate Parkinson's disease model. Cell, 186(24), 5394-5410.e18.(20231102,中国科学院深圳先进技术研究院,路中华、戴辑、鲍进

 

报道了一种全新的基于逆向腺相关病毒(retrograde AAV)的神经调控策略,这一技术与现有左旋多巴和多巴胺受体激动剂类药物相比最大特点是可以实现对帕金森病累及的基底节神经环路的精准靶向干预,而不影响全脑全身任一其他多巴胺通路和系统,为帕金森病临床治疗提供了潜在的全新精准干预技术。(专家点评Cell | 路中华/戴辑/鲍进团队开发靶向神经调控策略为帕金森病干预带来新希望

 

48. Cao Jing., Li Wenjuan., Li Jie., Mazid Md Abdul., Li Chunyang., Jiang Yu., Jia Wenqi., Wu Liang., Liao Zhaodi., Sun Shiyu., Song Weixiang., Fu Jiqiang., Wang Yan., Lu Yong., Xu Yuting., Nie Yanhong., Bian Xinyan., Gao Changshan., Zhang Xiaotong., Zhang Liansheng., Shang Shenshen., Li Yunpan., Fu Lixin., Liu Hao., Lai Junjian., Wang Yang., Yuan Yue., Jin Xin., Li Yan., Liu Chuanyu., Lai Yiwei., Shi Xuyang., Maxwell Patrick H., Xu Xun., Liu Longqi., Poo Muming., Wang Xiaolong., Sun Qiang., Esteban Miguel A., Liu Zhen.(2023). Live birth of chimeric monkey with high contribution from embryonic stem cells. Cell, 186(23), 4996-5014.e24.(20231109,中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心,刘真、孙强;中国科学院广州生物医药与健康研究院,Miguel A. Esteban

 

首次成功构建了高比例胚胎干细胞来源的出生存活嵌合体猴,并证明了猴胚胎干细胞可以高效的贡献到胚外胎盘组织和生殖细胞。这对于理解灵长类胚胎干细胞全能性和非人灵长类模型构建具有重要意义。(Cell封面|刘真/Miguel/孙强合作在胚胎干细胞嵌合体猴研究取得突破

 

49. Shang Pan., Rong Naikang., Jiang Jing-Jing., Cheng Jie., Zhang Ming-Hui., Kang Dongwei., Qi Lei., Guo Lulu., Yang Gong-Ming., Liu Qun., Zhou Zhenzhen., Li Xiao-Bing., Zhu Kong-Kai., Meng Qing-Biao., Han Xiang., Yan Wenqi., Kong Yalei., Yang Lejin., Wang Xiaohui., Lei Dapeng., Feng Xin., Liu Xinyong., Yu Xiao., Wang Yue., Li Qian., Shao Zhen-Hua., Yang Fan., Sun Jin-Peng.(2023). Structural and signaling mechanisms of TAAR1 enabled preferential agonist design. Cell, 186(24), 5347-5362.e24.(20231113,山东大学,孙金鹏、杨帆;四川大学,邵振华;上海交通大学医学院,李乾;山东第一医科大学,王越

 

系统地分析了不同内源性胺类和SEP-363856激活TAAR1多种G蛋白信号的特征,解析了不同胺类激活TAAR1-Gs/Gq通路的分子机制和药理学特征,进而成功开发出同时具有Gs和Gq双激活活性的TAAR1小分子激动剂ZH8651,并在小鼠模型中验证了其改善精神分裂的作用。该研究为靶向TAAR1治疗精神分裂症的候选化合物设计及药物开发改造提供了重要参考。(专家点评Cell | 孙金鹏/邵振华/李乾/王越团队合作开发治疗精神分裂症的TAAR1靶向新药物

 

50. Gao Shuai., Yao Xia., Chen Jiaofeng., Huang Gaoxingyu., Fan Xiao., Xue Lingfeng., Li Zhangqiang., Wu Tong., Zheng Yupeng., Huang Jian., Jin Xueqin., Wang Yan., Wang Zhifei., Yu Yong., Liu Lei., Pan Xiaojing., Song Chen., Yan Nieng.(2023). Structural basis for human Ca1.2 inhibition by multiple drugs and the neurotoxin calciseptine. Cell, 186(24), 5363-5374.e16.(20231115,清华大学/深圳医学科学院,颜宁;北京大学,宋晨;武汉大学,高帅

 

揭示了自由状态、多种药物结合、多肽毒素结合的钙离子通道Cav1.2的高分辨结构。

 

51. Yu Yongqiang., Tang Wenxin., Lin Wenwei., Li Wei., Zhou Xiang., Li Ying., Chen Rong., Zheng Rui., Qin Guochen., Cao Wenhan., Pérez-Henríquez Patricio., Huang Rongfeng., Ma Jun., Qiu Qiqi., Xu Ziwei., Zou Ailing., Lin Juncheng., Jiang Liwen., Xu Tongda., Yang Zhenbiao.(2023). ABLs and TMKs are co-receptors for extracellular auxin. Cell, 186(25), 5457-5471.e17.(20231117,福建农林大学,徐通达、杨贞标

 

该研究报道了两个新的质外体定位的生长素结合蛋白,ABL1(ABP1-like protein 1)和ABL2,与生长素结合蛋白ABP1具有相似结构,在细胞膜上形成ABP1/ABLs-TMK生长素共受体感受并传递胞外生长素信号,调控植物生长和发育的分子机制。

 

52. Sang Di., Lin Keteng., Yang Yini., Ran Guangdi., Li Bohan., Chen Chen., Li Qi., Ma Yan., Lu Lihui., Cui Xi-Yang., Liu Zhibo., Lv Sheng-Qing., Luo Minmin., Liu Qinghua., Li Yulong., Zhang Eric Erquan.(2023). Prolonged sleep deprivation induces a cytokine-storm-like syndrome in mammals. Cell, 186(25), 5500-5516.e21.(20231127,北京生命科学研究所/清华大学,张二荃

 

发现小鼠长时间睡眠剥夺将导致严重细胞因子风暴,并且揭示了睡眠剥夺导致外周免疫反应的神经分子机制——脑源PGD2/DP1信号通路。(Cell丨张二荃实验室揭示睡眠不足导致炎症反应的生理机制

 

53. Wei Yulei., Zhang E., Yu Leqian., Ci Baiquan., Guo Lei., Sakurai Masahiro., Takii Shino., Liu Jian., Schmitz Daniel A., Ding Yi., Zhan Linfeng., Zheng Canbin., Sun Hai-Xi., Xu Lin., Okamura Daiji., Ji Weizhi., Tan Tao., Wu Jun.(2023). Dissecting embryonic and extra-embryonic lineage crosstalk with stem cell co-culture. Cell. 186(26), 5859-5875.e24.(20231204,美国得克萨斯州西南医学中心,吴军;昆明理工大学,谭韬、季维智;中国农业大学,魏育蕾;中国科学院动物研究所,于乐谦

 

该研究意外发现在同一种培养体系下可以建立小鼠和食蟹猴囊胚来源的ESCs、XENs和TSCs细胞系,通过干细胞共培养方式构建囊胚时期细胞细胞互作环境,阐明了囊胚时期胚胎组织和胚外组织之间的相互作用及其调控机制。该研究不仅为胚胎和胚胎外组织之间互作机制解析提供了新的范式,也有助于我们深入理解早期胚胎发育的复杂调控模式。(Cell丨吴军/谭韬/季维智/魏育蕾/于乐谦团队利用同种培养条件建立早期胚胎三种干细胞系并解析早期发育时期细胞互作关系及机制

 

54. Li Yiye., Di Can., Song Shijian., Zhang Yubo., Lu Yiwen., Liao Jianyou., Lei Bingxi., Zhong Jian., Guo Kaihua., Zhang Nu., Su Shicheng.(2023). Choroid plexus mast cells drive tumor-associated hydrocephalus. Cell, 186(26), 5719-5738.e28.(20231205,中山大学,苏士成

 

借助单细胞核 RNA 测序 (snRNA-seq) 、空间转录组学技术以及小鼠模型,发现了脉络丛存在一个独特的肥大细胞群,他们称之为脉络丛肥大细胞 (CPMCs),并揭示了其在肿瘤相关脑积水中的作用。

 

55. Li Yanxin., Li Zhongqiu., Wang Changliang., Yang Min., He Ziqing., Wang Feiyang., Zhang Yuehong., Li Rong., Gong Yunxia., Wang Binhong., Fan Baoguang., Wang Chunyue., Chen Lei., Li Hong., Shi Peifu., Wang Nana., Wei Zhifeng., Wang Yan-Ling., Jin Lei., Du Peng., Dong Ji., Jiao Jianwei.(2023). Spatiotemporal transcriptome atlas reveals the regional specification of the developing human brain. Cell, 186(26), 5892-5909.e22.(20231212,中国科学院动物研究所,焦建伟;广州国家实验室,董骥;北京大学,杜鹏、靳蕾

 

该研究将单细胞测序(scRNA-seq)和单细胞空间转录组技术(scStereo-seq)相结合,首次解析了迄今为止跨时间点最广(GW6-GW23)、面积最大(最大4cm x 3cm)的人脑多区域时空发育转录组图谱。该研究鉴定并呈现了发育早期具有特定空间分布特点的异质性放射状胶质细胞亚型,揭示了这些异质性放射状胶质细胞有助于随后不同脑区神经元的特化,同时发现胶质细胞和神经元互作也会促进神经元的区域特化。(专家点评Cell丨焦建伟/董骥/杜鹏/靳蕾合作解析迄今最全面的人脑多区域时空发育图谱及规律

 

56. Liao Yu-Ying., Zhang Huibing., Shen Qingya., Cai Chenxi., Ding Yu., Shen Dan-Dan., Guo Jia., Qin Jiao., Dong Yingjun., Zhang Yan., Li Xiao-Ming.(2023). Snapshot of the cannabinoid receptor 1-arrestin complex unravels the biased signaling mechanism. Cell,186(26), 5784-5797.e17.(20231214,浙江大学,李晓明张岩

 

阐明了大麻素受体CB1介导β-arrestin信号的关键结构决定因素以及下游G蛋白和β-arrestin选择性信号转导机制,为推动开发精细调控CB1功能信号的合成大麻素奠定基础,从而在保留大麻治疗效果的同时规避其副作用。(Cell | 李晓明/张岩合作破译大麻素受体选择性信号转导机制

 

57. Chen Yuping., Wu Jinhuan., Zhai Linhui., Zhang Tingting., Yin Hui., Gao Huanyao., Zhao Fei., Wang Zhe., Yang Xiaoning., Jin Mingpeng., Huang Bingsong., Ding Xin., Li Rui., Yang Jie., He Yiming., Wang Qianwen., Wang Weibin., Kloeber Jake A., Li Yunxuan., Hao Bingbing., Zhang Yuanyuan., Wang Jiadong., Tan Minjia., Li Ke., Wang Ping., Lou Zhenkun., Yuan Jian.(2023). Metabolic regulation of homologous recombination repair by MRE11 lactylation. Cell.(20231220,同济大学,袁健

 

揭示了蛋白乳酸化修饰链接肿瘤代谢与DNA损伤修复的关键分子机制,并提供了潜在的肿瘤治疗靶点与策略。(Cell | 袁健团队揭示乳酸化修饰调控同源重组修复新机制

 

 
第一作者单位国内

 

 
58. Fan Shaohua., Spence Jeffrey P., Feng Yuanqing., Hansen Matthew E B., Terhorst Jonathan., Beltrame Marcia H., Ranciaro Alessia., Hirbo Jibril., Beggs William., Thomas Neil., Nyambo Thomas., Mpoloka Sununguko Wata., Mokone Gaonyadiwe George., Njamnshi Alfred., Folkunang Charles., Meskel Dawit Wolde., Belay Gurja., Song Yun S., Tishkoff Sarah A.(2023). Whole-genome sequencing reveals a complex African population demographic history and signatures of local adaptation. Cell, 186(5), 923-939.e14.(20230302,美国宾夕法尼亚大学,Sarah A. Tishkoff;复旦大学,第一作者樊少华

 

研究中对极具代表性的非洲12个群体180个个体进行全基因组测序分析。这些民族地理分布广泛,以不同方式为生(包括农业,打猎收集和游牧),并且涵盖了非洲四个主要的语系。(Cell | 樊少华等利用全基因组测序揭示非洲人群的复杂演化历程与对环境的适应性进化

 

 
非研究性文章

 

 
59. Wang Dongfang., Liu Baolin., Zhang Zemin.(2023). Accelerating the understanding of cancer biology through the lens of genomics. Cell, 186(8), 1755-1771.(20230413,北京大学,张泽民

 

全面总结了肿瘤基因组学的发展历程以及其对理解肿瘤驱动机制与异质性、促进个体化精准肿瘤治疗的重要贡献,并强调了目前肿瘤基因组学研究视野的转化,即从对癌细胞本身特性的关注提升到对整个肿瘤“生态系统”的研究,最后讨论了肿瘤基因组学未来在推动基础肿瘤生物学理解与临床转化应用方面潜在的发展方向。(Cell综述 | 张泽民总结肿瘤基因组学的发展历程以及未来发展方向

 

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